当前解析结果
SmilChr07G001741| 统一基因 ID | SmilChr07G001741 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001741 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001741 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 14771814 - 14773774 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995426 |
|---|---|
| GeneID | 130995426 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130995426 |
| 原始查询 | SmilChr07G001741 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | calcium/calcium/calmodulin-dependent Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819315]; symbol=AT2G47010; hit=AT2G47010; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | calcium/calcium/calmodulin-dependent Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819315]; symbol=AT2G47010; hit=AT2G47010; species=arabidopsis; confidence=high |
| 拟南芥 | AT2G47010 (AT2G47010)calcium/calcium/calmodulin-dependent Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819315] identity=67.42; qcov=0.971; evalue=0.0; confidence=high |
| 水稻 | Os05g0272800- identity=60.61; qcov=0.994; evalue=0.0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF24804 (DUF7705) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995426 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 内质网 | 1.00000 | XP_057776684.1 |
| 2 | 胞外分泌 | 1.00000 | XP_057776685.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:14772000 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:14772057 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr7:14772089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:14772105 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr7:14772558 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B69 |
Chr7:14772692 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 28 | A11,B120,B124,B13,B14,B18,B27,B37,B40,B42,B43,B63,B67,B76,B91,C19,C2,C31,C49,C5,C52,C6,C64,C66,C7,C76,C77,D5 |
Chr7:14772701 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 35 | A19,A24,A4,A7,B115,B121,B128,B135,B136,B19,B20,B24,B32,B34,B46,B49,B54,B60,B62,B79,B9,C1,C22,C32,C33,C36,C46,C47,C50,C68,C74,C79,C8,C80,C85 |
Chr7:14772703 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 103 | A1,A11,A14,A18,A2,A20,A21,A23,A3,A5,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B110,B112,B118,B119,B123,B125,B130,B140,B16,B17,B21,B25,B27,B28,B29,B35,B36,B41,B45,B48,B50,B51,B52,B53,B57,B58,B59,B64,B66,B68,B69,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B82,B85,B86,B87,B88,B89,B94,B95,B98,C12,C13,C18,C19,C20,C28,C31,C37,C38,C39,C41,C42,C44,C48,C5,C51,C52,C57,C58,C6,C61,C62,C65,C7,C71,C73,C75,C77,C78,C81,C84,C86,C87,D1,D10,D2,D5 |
Chr7:14772757 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | B11,B114,B31,B64,B88,C24,C25,C3 |
Chr7:14773529 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr7:14773544 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B53,B77 |
Chr7:14773557 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776684.1PF24804
DUF7705 31-271 aa
XP_057776685.1PF24804
DUF7705 31-482 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776684.1 |
Pfam | PF24804 |
DUF7705 | Domain | 31 | 271 | 2.3e-114 | 383.4 | Domain of unknown function (DUF7705) |
XP_057776685.1 |
Pfam | PF24804 |
DUF7705 | Domain | 31 | 482 | 3e-251 | 834.7 | Domain of unknown function (DUF7705) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。