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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001978`

染色体: Chr07 坐标: 17375426-17378048 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001978`
名称	SmilChr07G001978
描述	squamosa promoter-binding-like protein 13A
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17375426 - 17378048 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995646`
GeneID	`130995646`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995646`
原始查询	`SmilChr07G001978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 13A
产物	squamosa promoter-binding-like protein 13A
Arabidopsis	`AT5G50570` (SPL13A) Squamosa promoter-binding protein-like (SBP domain) transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835126] identity=59.5; qcov=0.511; evalue=4.04e-41; confidence=medium
Rice	`Os08g0531600` (GW8) - identity=53.3; qcov=0.604; evalue=3.73e-41; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995646

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776996.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776996.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776996.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776996.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17375671`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr7:17375671`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr7:17375951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:17376326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776996.1

227 aa

114

227

SBP

PF03110 SBP 22-95 aa

XP_057776997.1

227 aa

114

227

SBP

PF03110 SBP 22-95 aa

XP_057776998.1

227 aa

114

227

SBP

PF03110 SBP 22-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776996.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	22	95	1.3e-31	109.4	SBP domain
`XP_057776997.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	22	95	1.3e-31	109.4	SBP domain
`XP_057776998.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	22	95	1.3e-31	109.4	SBP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921013.1
TAATTCGTTTTTTTTAATCTTCAAAATTAAGTTTTTTAATCACTTCTTACAAGGCTACTACCCCCAAAAAGGAATGTGTGTTTTAGGAGCCAAACTGGTAATTTTTGCTCTAATTCTTGTTTCCTAATAAGCCAAGTGTGTCTGAAAAGCCCACATCTCTAAAACACATACAAAAACAACCATTTTTGCAGCTTTCCTCCTGGCATCTTTCTTGCTTTGTGGACATGTGCAAGAATTTCTCCCTTTTTTCTTTTTAATAT...

XM_057921015.1
TTTTTGCTCTAATTCTTGTTTCCTAATAAGCCAAGTGTGTCTGAAAAGCCCACATCTCTAAAACACATACAAAAACAACCATTTTTGCAGCTTTCCTCCTGGCATCTTTCTTGCTTTGTGGACATGTGCAAGAATTTCTCCCTTTTTTCTTTTTAATATTTCTTCATATAAATGTTGATTTAGTAGGAAAATTAATGTTTATGTATTAGTGTAGTAGATTTTAGTCTTCTCCAATAATTCTCACATATAGATATAAACAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130995646
ATGGAATCATCATCCTCATCGAAAAGGGCCAAGGCCCCTGCAAATGTTGCTCAAGTTGCTCATTGCTTGGTGGACGGATGCAGCGCTGATTTAAGCGTGTGCAGAGACTATCACAGGCGGCACAAGGTCTGTGAAGCTCACTCCAAGACCCCTAAGGTCACGATTGGGGGTCGAGAGCAGCGCTTTTGCCAGCAATGCAGCAGGTTCCACTCCCTGGTGGAGTTTGACGAGGGAAAACGAAGCTGTAGGAAACGGCTTGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057776996.1
MESSSSSKRAKAPANVAQVAHCLVDGCSADLSVCRDYHRRHKVCEAHSKTPKVTIGGREQRFCQQCSRFHSLVEFDEGKRSCRKRLDGHNRRRRKAQARSVTGVEERLVSFSSSAPQIVVGGGVVGYPWSGVVVKDENEIGVLQQQQQLNYMDSAASAAHHHHHQHQLSSSSAFVDPNVMMECDGALSLLSSPPPAIIDYHQTTSPTLHFPHQNVGSSHQTLSFMWD

XP_057776997.1
MESSSSSKRAKAPANVAQVAHCLVDGCSADLSVCRDYHRRHKVCEAHSKTPKVTIGGREQRFCQQCSRFHSLVEFDEGKRSCRKRLDGHNRRRRKAQARSVTGVEERLVSFSSSAPQIVVGGGVVGYPWSGVVVKDENEIGVLQQQQQLNYMDSAASAAHHHHHQHQLSSSSAFVDPNVMMECDGALSLLSSPPPAIIDYHQTTSPTLHFPHQNVGSSHQTLSFMWD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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