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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002009`

染色体: Chr07 坐标: 17875630-17879971 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002009`
名称	SmilChr07G002009
描述	serine/threonine-protein kinase PBS1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17875630 - 17879971 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995670`
GeneID	`130995670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995670`
原始查询	`SmilChr07G002009`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase PBS1
产物	serine/threonine-protein kinase PBS1
Arabidopsis	`AT5G13160` (PBS1) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831155] identity=76.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0513000` (OsRLCK72) - identity=62.1; qcov=1.16; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777025.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777025.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777025.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777025.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17876204`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B88
`Chr7:17876204`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B88
`Chr7:17877924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17877987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B73
`Chr7:17877988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:17878825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B13,C2
`Chr7:17878909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:17879146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:17879255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr7:17879324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17879343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B8,C58
`Chr7:17879486`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777025.1

450 aa

225

450

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 88-294 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 90-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777025.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	88	294	5.8e-40	138.1	Protein kinase domain
`XP_057777025.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	90	290	1e-42	147.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921042.1
ATATATAAGAACTAATAAGAAGTGTGTATTATTCATGTGCACTAGTGCGTCTGCGTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGGTTTTGGCTAACTGTGTATGAAAGGAAAAGCCGAAGACAAAGCCGGCTAAAACTCTGTTCACAATACACGGTGTTTTGTCAATTAGATTCTACAATCTGTCAAAACTAAATTACTGCAACTTCCCCTAAATTTGTTTCCGGCCCTTTTTCCTTATATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995670
ATGGGCTGTTTTCCTTGTTTTGATTCAAGAGAAGAGCAGAAGCTCAATCCCAATAAAGATAGGGATGATCACAATGAAGTTCAAACAGCTATCCCTTCCAATATATCAAAGCTATCTTCTGGGGGAGATAGGCTGAAGTCGAGGAGCAATGTTGGCCCTAAGAGGGAGGCATCAGCCCTGAAGGACTTGCCCGATTCTCAGATTGCTGCGCAAACATTTACTTTCCGTGAACTAGCTGCTGCCACCAATAACTTCAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777025.1
MGCFPCFDSREEQKLNPNKDRDDHNEVQTAIPSNISKLSSGGDRLKSRSNVGPKREASALKDLPDSQIAAQTFTFRELAAATNNFRPESFLGEGGFGRVYKGRLHNGQVVAVKQLDRNGLQGNREFLVEVLMLSLLHNPHLVNLMGYCADGDQRLLVYEFMPLGSLEDHLHDLPPDKEPLDWSTRMKIAAGAAKGLEHLHDKANPPVIYRDFKSSNILLGEGFVPKLSDFGLAKLGPTGDKSHVSTRVMGTYGYCAPEYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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