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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002147`

染色体: Chr07 坐标: 19649448-19652869 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002147`
名称	SmilChr07G002147
描述	transcription factor SRM1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19649448 - 19652869 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993241`
GeneID	`130993241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993241`
原始查询	`SmilChr07G002147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor SRM1
产物	transcription factor SRM1
Arabidopsis	`AT5G08520` (AT5G08520) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830751] identity=66.2; qcov=1.03; evalue=9.23e-117; confidence=high
Rice	`Os04g0676700` (MYB) - identity=58.3; qcov=0.993; evalue=1.75e-91; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF23082 (Myb_DNA-binding_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774045.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057774045.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774045.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774045.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19650502`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr7:19650502`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr7:19650687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B107,C71
`Chr7:19650748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B99,C48,D3
`Chr7:19650780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B93,D5
`Chr7:19650797`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B128,B2,B92,C2,C22,C23,C38,C69,C72,C82,C83,C86,D2
`Chr7:19652200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:19652218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C26
`Chr7:19652401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:19652455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:19652482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:19652528`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A2,B103,B107,B129,B136,B139,B140,B5,B62,B77,B78,C14,C60,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774045.1

273 aa

136

273

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-binding_2

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 10-55 aa PF23082 Myb_DNA-binding_2 11-56 aa PF00249 Myb_DNA-binding 117-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774045.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	10	55	4.5e-23	81.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057774045.1`	Pfam	`PF23082`	Myb_DNA-binding_2	Domain	11	56	6e-10	39.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057774045.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	117	162	4.5e-23	81.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918062.1
ACCTTTTCCAATTTTCAACTATTCATTGTGCGAGCTTTGGTAAACTGTCAAAAGATGGTTATAAAGTAAATATCAGTTGAAAAGGTTGCGATTCTTTCGAGTATGTCTACCTTTTTCACAGATTTGTACGCTTCTTCATGTCTTTTTCTTGTGCTGTTAAAACGGGTGTTGGTAGGAAATGGGAATCATTGATTTTCGATTCCTTCATCATTTTCTTCTTCTTTGTTATTCAAAAATGTTAAATGGGATTTTTTCGGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993241
ATGCCTGCTGTTGAATCAAGTAGCTCTGTGTGGAGTAGGGAGCAGGATAAGCAGTTTGAGAAGGCAATAGCTGCTTACCCTGAGAATTCTTCAGATAGATGGGAGAAGATTGCTGCTGATGTTTGTGGGAAATCAGTGGAGGAGATTAAGCATCACTATCAACTCCTAGTTGATGATGTTAGCCGCATAGAATCCGGTTTTGTTGAGGTTCCTAGTTACAATTCATCTTCAGATGGCTCAAACGGCCTTGCTGCTGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774045.1
MPAVESSSSVWSREQDKQFEKAIAAYPENSSDRWEKIAADVCGKSVEEIKHHYQLLVDDVSRIESGFVEVPSYNSSSDGSNGLAADDGASKKGGSFGHLNGDAKASRSDQERRKGIAWTEDEHRLFLLGLDKYGKGDWRSISRNFVVTRTPTQVASHAQKYFIRLNSMNKDRRRSSIHDITSVANGDVSVPQGPITGQTNGGPPAKPNKQVVGSAAQGVTMYGAPTMGQPLGVVSAVGTPVSLPPPPHMAYGVGTPVPMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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