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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002226`

染色体: Chr07 坐标: 20481942-20487292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002226`
名称	SmilChr07G002226
描述	caffeic acid 3-O-methyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20481942 - 20487292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993304`
GeneID	`130993304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993304`
原始查询	`SmilChr07G002226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeic acid 3-O-methyltransferase 1-like
产物	caffeic acid 3-O-methyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G54160` (OMT1) O-methyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835504] identity=59.6; qcov=0.983; evalue=7.56e-148; confidence=high
Rice	`Os08g0157500` (ROMT9) - identity=47.7; qcov=1.01; evalue=2.44e-106; confidence=high
GO	GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0019438 (GO:0019438); GO:0032259 (methylation); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00891 (Methyltransf_2); PF08100 (Dimerisation)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774124.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774124.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774124.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774124.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20482184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A13
`Chr7:20482184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:20482295`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B101,B22,B24,B33,B56,B66,B96,C53,D5
`Chr7:20482408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:20482425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B73,C71,D11
`Chr7:20484505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:20484738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:20484811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774124.1

348 aa

174

348

Dimerisation

Methyltransf_2

PF08100 Dimerisation 11-101 aa PF00891 Methyltransf_2 124-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774124.1`	Pfam	`PF08100`	Dimerisation	Domain	11	101	8.7e-16	58.4	O-methyltransferase dimerisation domain
`XP_057774124.1`	Pfam	`PF00891`	Methyltransf_2	Domain	124	330	1e-66	225.0	O-methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918141.1
AAACAAGTTTAAACAATAAACAAAAAAGGTGCGGAAAATTGCAATATTTGAGAATGAAGCGTTCATCAGAGTCGAGAATGGCCATGCAACTAATTGGTGACTGTGTAGTCCCAAGGGCACTGGCAACTGCTATACAACTCGACCTGCTCGAGATTATGAAGAAAGCCGGTTCCGGCGTCTTTCTTTCGCCGCCGCAATTGGCTGCCCTAATTCCGGCCACTAACCCGGAGGCCCACCTCATGATTGACCGGATCCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993304
ATGAAGCGTTCATCAGAGTCGAGAATGGCCATGCAACTAATTGGTGACTGTGTAGTCCCAAGGGCACTGGCAACTGCTATACAACTCGACCTGCTCGAGATTATGAAGAAAGCCGGTTCCGGCGTCTTTCTTTCGCCGCCGCAATTGGCTGCCCTAATTCCGGCCACTAACCCGGAGGCCCACCTCATGATTGACCGGATCCTCCGCCTTCTCGCCGCCGCCAACATTCTAGAGTGCAAGCGGCCCGACAGCGACGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774124.1
MKRSSESRMAMQLIGDCVVPRALATAIQLDLLEIMKKAGSGVFLSPPQLAALIPATNPEAHLMIDRILRLLAAANILECKRPDSDGDRFYSLAPVCKFFTKNEDGVSMAPLLLLSQDKVFTETWYHLKDAIVEGGNPFHRAHGMSVFEYSTIDPRFNKIFDEAMSGHSNMFMNEILEMYKGFEGVKSLVDVGGGIGSSLKIILSKYPSIKAINFDLPHVIQHAPSHPGVEHVSGDMFVSVPKGDAIFIKWILHNWSDADC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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