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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002294`

染色体: Chr07 坐标: 21211225-21214338 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002294`
名称	SmilChr07G002294
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 61
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21211225 - 21214338 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993372`
GeneID	`130993372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993372`
原始查询	`SmilChr07G002294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 61
产物	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 61
Arabidopsis	`AT5G53370` (PMEPCRF) pectin methylesterase PCR fragment F [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835418] identity=65.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0288100` (OsPME8) - identity=55.3; qcov=0.759; evalue=2.31e-174; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057774220.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057774220.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774220.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774220.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21211639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A9,B69,C4
`Chr7:21211713`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr7:21211713`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C50
`Chr7:21211796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B98,C33,C48
`Chr7:21212031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,D5
`Chr7:21212039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B26
`Chr7:21212102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C32,C68
`Chr7:21212592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr7:21213251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C34,C70
`Chr7:21213378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B6,C67
`Chr7:21213454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,C19,C40,C55
`Chr7:21213529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B48,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774220.1

584 aa

292

584

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 73-216 aa PF01095 Pectinesterase 270-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774220.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	73	216	1.6e-33	116.7	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057774220.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	270	567	8.9e-149	494.9	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918237.1
CCATATATATACCCATTAACCCAGTCACCTCCCATAGCAAACGCCACATTCTTTCCCATCTGCTTTCTTCTCCTCTACTTTTTTATTTTCTACTTTTTTATCTAAAAATAAAAAGAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAACGATGGATTATGGCAGGCTCGGGAAAGCCGAGGCAGGTGGCACCTCCACCCAAATCCAAACCACCGACCTCGCCCCTAAACCAAAAGTGTCGAAAGTCCGGCTCCTCCTCATGATCGCCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993372
ATGGATTATGGCAGGCTCGGGAAAGCCGAGGCAGGTGGCACCTCCACCCAAATCCAAACCACCGACCTCGCCCCTAAACCAAAAGTGTCGAAAGTCCGGCTCCTCCTCATGATCGCCGCCACACTAATGGTGGTGTCGGCCGTGTCCGCCGCGGTGGCGGTGGTGATACGACACAAAGGCGAGTCGAAAGTGCAGAATCGGCGGCCGTCTCAAGCCATGTCGAGAGCATGCAGCCGCACGCTGTACCCAAGTCTCTGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774220.1
MDYGRLGKAEAGGTSTQIQTTDLAPKPKVSKVRLLLMIAATLMVVSAVSAAVAVVIRHKGESKVQNRRPSQAMSRACSRTLYPSLCLNSLLDFPGALTADEKALVHISLNLTLQKVGRSLYVSSEITNLAMDPHVRSAYDDCLELLDHSVDLLSRSLTSAAEPPGSTQDVLTWLSAALTNQDTCREGFDELNGDVKNQMSDRIKDLSEIVSNSLAIYASAGGDDGFSDIPIQNRRRRLLRDEKEREQFPVWLSRRERLLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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