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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002347`

染色体: Chr07 坐标: 21801855-21804396 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002347`
名称	SmilChr07G002347
描述	probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21801855 - 21804396 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993432`
GeneID	`130993432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993432`
原始查询	`SmilChr07G002347`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
产物	probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G52840` (AT5G52840) NADH-ubiquinone oxidoreductase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835361] identity=71.9; qcov=1; evalue=2.07e-89; confidence=high
Rice	`Os03g0313000` - identity=69.2; qcov=0.893; evalue=1.5e-77; confidence=high
GO	GO:0005747 (GO:0005747); GO:0022904 (respiratory electron transport chain)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04716 (ETC_C1_NDUFA5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774296.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057774296.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057774296.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774296.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21802139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B59,B75,B93,D11
`Chr7:21802152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B117
`Chr7:21802173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B64,C19,C31
`Chr7:21802220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C77
`Chr7:21803983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C40,C55
`Chr7:21803987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C41,C44,C71,C74,D1
`Chr7:21804014`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr7:21804014`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr7:21804031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B59,B75,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774296.1

178 aa

178

ETC_C1_NDUFA5

PF04716 ETC_C1_NDUFA5 24-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774296.1`	Pfam	`PF04716`	ETC_C1_NDUFA5	Family	24	90	4.7e-28	97.5	ETC complex I subunit conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918313.1
GAGGGGACGGGGAATTAAAAGAAAAAACCGAATATGTGTGTAGGGAAGAGAATTGGGCTTTTCTTATGAGTACATATAGCCCAGCCCATTCTAATTCTTCAACAAGAATCTCCCAAATGCAGCAAGCCCATTCCGAGCCCAATCGCCAATTATCGGAGATTACATTCATCTTGTAAATGGTTTCTCCCTGAGTGAGCTGAGCGAGCGTCGATCGAGTTAACCGAGTAGTCGAAATCCAAGGGGGGAAAAAAAGGAAACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993432
ATGTTTCTCCGGCGGGTTGCGCGGCCGCTGATGATGATGGCGAAAGTGAAGGAGACGACGGGGATCGTCGGCCTCGACGTCGTACCCAACGCGCGTGAGGTGCTCATCGGGCTCTACTCCAAAACCCTAGAGGAGATCAAAGCGGTGCCGGAAGACGAGGGGTACCGCAAGGCCGTCGAGAGCTTCACGCGCCACCGACTCAAGGTGTGTCAGGAGGAGGAGGATTGGGAATCCATCGAGAACAAGCTCGGATGTGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774296.1
MFLRRVARPLMMMAKVKETTGIVGLDVVPNAREVLIGLYSKTLEEIKAVPEDEGYRKAVESFTRHRLKVCQEEEDWESIENKLGCGQVEELIEEAQDELTLIGRMIEWNPWDVPEDYECEVVENDAPVPKHVPLHRPGPLPEEFYKTLAAIDTGSLKDVLPSSKEETPAVSSGEAPAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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