当前解析结果
SmilChr07G002465| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002465 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002465 |
| 描述 | probable fructokinase-7 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 23184753 - 23188121 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993543 |
|---|---|
| GeneID | 130993543 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993543 |
| 原始查询 | SmilChr07G002465 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable fructokinase-7 |
| 产物 | probable fructokinase-7 |
| Arabidopsis | AT5G51830 (AT5G51830)pfkB-like carbohydrate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835258] identity=72.4; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os06g0232200- identity=68.2; qcov=0.936; evalue=2.29e-155; confidence=high |
| GO | GO:0005829 (cytosol); GO:0006000 (fructose metabolic process); GO:0008865 (fructokinase activity) |
| KEGG | smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00294 (PfkB) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993543 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057774453.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057774453.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057774453.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057774453.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774453.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:23185053 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:23185102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr7:23185548 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:23185829 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B47,B9,C35 |
Chr7:23185863 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C58,C72,D1 |
Chr7:23186050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B47,B9,C35 |
Chr7:23186948 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B47,B9,C35 |
Chr7:23186956 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B41,B84,C37,D4 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057774453.1PF00294
PfkB 25-333 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057774453.1 |
Pfam | PF00294 |
PfkB | Domain | 25 | 333 | 1.1e-75 | 255.5 | pfkB family carbohydrate kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。