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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002561`

染色体: Chr07 坐标: 24349118-24351306 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002561`
名称	SmilChr07G002561
描述	high affinity nitrate transporter 2.5
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24349118 - 24351306 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993632`
GeneID	`130993632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993632`
原始查询	`SmilChr07G002561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high affinity nitrate transporter 2.5
产物	high affinity nitrate transporter 2.5
Arabidopsis	`AT1G12940` (NRT2.5) nitrate transporter2.5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837852] identity=71.4; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0704100` (NRT2.3) - identity=69.4; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0015113 (nitrite transmembrane transporter activity); GO:0015706 (nitrate transmembrane transport); GO:0015707 (nitrite transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057774576.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057774576.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057774576.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057774576.1`
5	Synaptic vesicle	Synaptic vesicle	0.20000	`XP_057774576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24349310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:24349322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:24349401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:24349455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:24349600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:24349738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:24349800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B115,B124,B20
`Chr7:24349839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:24350008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B37
`Chr7:24350017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:24350057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:24350092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C83,D2,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774576.1

505 aa

252

505

MFS_1

PF07690 MFS_1 45-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774576.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	45	401	2e-23	83.6	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918593.1
TGGATTCCTCGTAAGCAGGCTCCAAAGTCAGTGGACGCAACCAATAGTAAACTCAAGCATCCTTTTCCTTCTACATAGAAAGACTTGAAATTCTTCACAACAAGGCATTAACAACTCAAACTTGCGCGCCAATCTCTCCCCCTAAACGCGGATTCGCATGTGGGTTTTGCAATCTTCATACCTTCTTACATGTCAAACAACAAGTTAGCTCTGAGACTCGACGGCAGTGAAGCAAATTTTGGGCCTTTGGAATTTGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993632
ATGGAGGTTTCGAATGGAGCAGAAGAAGCTTCTGGAAAGAAGTTTGCACTTCCGGTGGACTCCGAGCACAAGTCGACCGAGTTCAGACTATTCTCGGTGGCAGCGCCTCACATGCGGGCGTTTCATCTATCGTGGATTTCCTTCTTCGCGTGCTTCGTCTCCACGTTTGCTGCTCCGCCTCTGCTGCCAGTGATCCGCGACAATCTTGGCCTAACTGCAACCGACATTGGGAATGCCGGAATAGCCGCTGTCTCCGGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774576.1
MEVSNGAEEASGKKFALPVDSEHKSTEFRLFSVAAPHMRAFHLSWISFFACFVSTFAAPPLLPVIRDNLGLTATDIGNAGIAAVSGAVFARIAMGTACDLFGPRLASAALTLLTAPAVYCTAIATSPASFLLVRFFTGFSLATFVSTQFWMSSLFSSKVVGTANGVAGGWGNLGGGATQLIMPLVFDLIKHVGSSQYTAWRIAFFVPGLFQTLSAYGIFFLGQDLPDGNYSQLQKSGDKHKDSFKQVLYHAVTNYRGWIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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