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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002567`

染色体: Chr07 坐标: 24493635-24494528 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G002567`
名称	SmilChr07G002567
描述	uncharacterized SmilChr07G002567
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24493635 - 24494528 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993998`
GeneID	`130993998`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130993998`
原始查询	`SmilChr07G002567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=weak
拟南芥	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=23.98; qcov=0.872; evalue=6.69e-13; confidence=weak
水稻	`Os03g0643433` - identity=27.04; qcov=0.66; evalue=5.46e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993998

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	0.80000	`XP_057775020.1`
2	细胞质基质	0.60000	`XP_057775020.1`
3	细胞核	0.20000	`XP_057775020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24493725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:24493768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr7:24493771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A1,A21,B101,B108,B117,B139,B4,B41,B49,B51,B57,B58,B59,B60,B71,B72,B74,B79,B8,C20,C32,C36,C48,C68,C75
`Chr7:24493847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:24493887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:24493962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:24494028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B5,B95,C82,C85
`Chr7:24494031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:24494049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:24494115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B123,B35,B68,C4
`Chr7:24494137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C45
`Chr7:24494149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775020.1

297 aa

148

297

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 99-193 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057775020.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	99	193	4.4e-19	69.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919037.1
ATGTTTGTCGGGGATGGGCAGTCCACAAAATTCTGGGATCACAAGTGGGCGGGGTCGATGCCTCTCAAGCTGATGTTTCCTAGGTTGTACCTCCTTAGTGCTAATAAAGAAGCCCTCATTAGTGAGTCGGGTTCTTGGGAGAATGGGGGCTGGAAGTGGGATCTGAGTTGGCGACGAGAGCTCTTCGAAAGGGAAAAGAGTGGGGTTCATGACCTGTTGTCTTTCATTTCTGGTGCTAACCTTGTTGCAGGAGTGCCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057775020.1_37782
ATGTTTGTCGGGGATGGGCAGTCCACAAAATTCTGGGATCACAAGTGGGCGGGGTCGATGCCTCTCAAGCTGATGTTTCCTAGGTTGTACCTCCTTAGTGCTAATAAAGAAGCCCTCATTAGTGAGTCGGGTTCTTGGGAGAATGGGGGCTGGAAGTGGGATCTGAGTTGGCGACGAGAGCTCTTCGAAAGGGAAAAGAGTGGGGTTCATGACCTGTTGTCTTTCATTTCTGGTGCTAACCTTGTTGCAGGAGTGCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775020.1
MFVGDGQSTKFWDHKWAGSMPLKLMFPRLYLLSANKEALISESGSWENGGWKWDLSWRRELFEREKSGVHDLLSFISGANLVAGVPDDWFWSAAKDGIYSTKSAYEAIKETRQERQNSEAINEILSKVWKSPVPLKARVMAWWTLRDRLPTCANLRRRNIVLNEVDTGCNACFHSEETINHLLFHCPKTEKVWDDIFRWLGICFVRPQSVVSHFLLFTNFGNRKESRKFLPALWCCVVWVVWRCRNASRFEGKGWEISKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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