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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002569`

染色体: Chr07 坐标: 24521487-24523541 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002569`
名称	SmilChr07G002569
描述	tryptophan aminotransferase-related protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24521487 - 24523541 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993637`
GeneID	`130993637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993637`
原始查询	`SmilChr07G002569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tryptophan aminotransferase-related protein 1-like
产物	tryptophan aminotransferase-related protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G70560` (TAA1) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843393] identity=52; qcov=0.884; evalue=1.41e-141; confidence=high
Rice	`Os01g0169800` (FIB) - identity=52.4; qcov=0.911; evalue=7.9e-136; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0016846 (carbon-sulfur lyase activity)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF04864 (Alliinase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774583.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057774583.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774583.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774583.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24521904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D3
`Chr7:24522061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:24522122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:24522537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:24522576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:24522663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B62,C61
`Chr7:24522937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr7:24523196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774583.1

415 aa

208

415

Alliinase_C

Aminotran_1_2

PF04864 Alliinase_C 47-408 aa PF00155 Aminotran_1_2 91-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774583.1`	Pfam	`PF04864`	Alliinase_C	Domain	47	408	3.7e-141	471.0	Allinase
`XP_057774583.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	91	395	6.4e-10	39.5	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918600.1
TAATGGAGGAAACAGTTGCGATCGGCCACACATTGTTTAATTCAAACACAAACAAAAACTGTAGTTAGTTTGAGAAAAATCAAGCAAGAATGTGCGGCACCTTCGAGGTCCTCGTCACCAAAACCTCCAAGACTACTTCCTCTGATCTTCAAACCGCAGACAATAGTAACGGCCACCTCCGACCCAATGGCGTCGCGCCACATCATCATCACCCTCAACCCCTCGTCTCTCTCGATCACGGCGATCCGACAATGTACGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993637
ATGTGCGGCACCTTCGAGGTCCTCGTCACCAAAACCTCCAAGACTACTTCCTCTGATCTTCAAACCGCAGACAATAGTAACGGCCACCTCCGACCCAATGGCGTCGCGCCACATCATCATCACCCTCAACCCCTCGTCTCTCTCGATCACGGCGATCCGACAATGTACGAGTCGTATTGGGAAAAGGTTGGGCAAAAGTGCAGTGTGACTATGTCGGGATTCCAATCTCTGAGTTACTTCGGCAACGGTAAAACCCTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774583.1
MCGTFEVLVTKTSKTTSSDLQTADNSNGHLRPNGVAPHHHHPQPLVSLDHGDPTMYESYWEKVGQKCSVTMSGFQSLSYFGNGKTLCWFMEQKLEDEIRKLHKVAGNAVVEGRHIVVGTGSSQLILAALYALADTLNLPNPVDVVSAAPYYSSYPEMIEFLRTGLFKWSGDARCFNKDVPYIEFVTSPNNPDGSTREAAVNRGELGMLVHDLAYYWPQYTAITSPADHDLMLFTASKCTGHAGSRIGWAIVRDENVARKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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