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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002587`

染色体: Chr07 坐标: 24760582-24766378 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002587`
名称	SmilChr07G002587
描述	spermidine synthase 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24760582 - 24766378 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993656`
GeneID	`130993656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993656`
原始查询	`SmilChr07G002587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	spermidine synthase 1
产物	spermidine synthase 1
Arabidopsis	`AT1G70310` (SPDS2) spermidine synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843367] identity=79.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0408700` (OsSPDS1) - identity=86.6; qcov=0.861; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004766 (spermidine synthase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0008295 (spermidine biosynthetic process)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01564 (Spermine_synth); PF17284 (Spermine_synt_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774621.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774621.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774621.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774621.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24762910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,C15,C21,D11
`Chr7:24762928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:24763495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B48,B69,B84,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774621.1

344 aa

172

344

Spermine_synt_N

Spermine_synth

PF17284 Spermine_synt_N 52-106 aa PF01564 Spermine_synth 109-297 aa

XP_057774622.1

346 aa

173

346

Spermine_synt_N

Spermine_synth

PF17284 Spermine_synt_N 52-106 aa PF01564 Spermine_synth 109-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774621.1`	Pfam	`PF17284`	Spermine_synt_N	Domain	52	106	2.1e-24	85.9	Spermidine synthase tetramerisation domain
`XP_057774621.1`	Pfam	`PF01564`	Spermine_synth	Domain	109	297	3.1e-80	268.9	Spermine/spermidine synthase domain
`XP_057774622.1`	Pfam	`PF17284`	Spermine_synt_N	Domain	52	106	2.1e-24	85.8	Spermidine synthase tetramerisation domain
`XP_057774622.1`	Pfam	`PF01564`	Spermine_synth	Domain	109	299	7.6e-78	261.0	Spermine/spermidine synthase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918639.1
GCAATTATATTAGGTCACTCAAGCAGAAAGCCACCGCGCGTCTTTCCTAAGCAGATTCTCTCCAATCAATTCTCACGCACTCGCACACTCTTCCGCGTGAACATATACATACACATATAGAGACAACACTCTATACCCTCTACTATATAACCAGTCGGGCTGAGCGTATGGCAGAGGCGGCTGCTCAATCTGCGGGTGAATTGCCGGTGAAGAGACCGCGCGAAGAGGAGGAGGTGGAGAACGGCGGCGTTTCGGTTGAG...

XM_057918638.1
GCAATTATATTAGGTCACTCAAGCAGAAAGCCACCGCGCGTCTTTCCTAAGCAGATTCTCTCCAATCAATTCTCACGCACTCGCACACTCTTCCGCGTGAACATATACATACACATATAGAGACAACACTCTATACCCTCTACTATATAACCAGTCGGGCTGAGCGTATGGCAGAGGCGGCTGCTCAATCTGCGGGTGAATTGCCGGTGAAGAGACCGCGCGAAGAGGAGGAGGTGGAGAACGGCGGCGTTTCGGTTGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993656
ATGGCAGAGGCGGCTGCTCAATCTGCGGGTGAATTGCCGGTGAAGAGACCGCGCGAAGAGGAGGAGGTGGAGAACGGCGGCGTTTCGGTTGAGATGGAAGCGAATAACGGAGCGGCGACGGAGCTGCCCGAGTGCATGTCGTCTGTTATCCCGGGGTGGTTCTCGGAGATTAGCCCAATGTGGCCAGGAGAAGCGCACTCACTGAAGGTAGAAAAGATATTGTTTCAGGGGAAATCTGATTATCAGAATGTCATTGTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774621.1
MAEAAAQSAGELPVKRPREEEEVENGGVSVEMEANNGAATELPECMSSVIPGWFSEISPMWPGEAHSLKVEKILFQGKSDYQNVIVFQSSTYGKVLVLDGVIQLTERDECAYQEMITHLPLCSIPNPRKVLVIGGGDGGVLREVSRHASVEKIDICEIDKMVVDVSKQYFPNVAVGFDDPRVTLHIGDGVAFLKAVPEGTYDAVIVDSSDPIGPAQELFEKPFFASVAKALRPGGVVCTQAESIWLHMHIIEDIVANCCQ...

XP_057774622.1
MAEAAAQSAGELPVKRPREEEEVENGGVSVEMEANNGAATELPECMSSVIPGWFSEISPMWPGEAHSLKVEKILFQGKSDYQNVIVFQSSTYGKVLVLDGVIQLTERDECAYQEMITHLPLCSIPNPRKVLVIGGGDGGVLREVSRHASVEKIDICEIDKMVVDVSKQYFPNVAVGFDDPRVTLHIGDGVAFLKAVPEGTYDAVIVDSSDPIGPAQELFEKPFFASVAKALRPGGVVCTQAESIWLHMHIIEDIVANCCQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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