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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002715`

染色体: Chr07 坐标: 26612754-26616472 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002715`
名称	SmilChr07G002715
描述	uncharacterized SmilChr07G002715
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26612754 - 26616472 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995726`
GeneID	`130995726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995726`
原始查询	`SmilChr07G002715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837215]; symbol=AT1G07040; hit=AT1G07040; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837215]; symbol=AT1G07040; hit=AT1G07040; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G07040` (AT1G07040) plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837215] identity=61.3; qcov=0.978; evalue=2.61e-158; confidence=high
Rice	`Os10g0463800` (FLO7) - identity=70.8; qcov=0.814; evalue=6.61e-156; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07063 (HGLS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777108.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057777109.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057777108.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777108.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26613316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:26613427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B99
`Chr7:26613983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:26614250`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A1,B117,B139,B4,B41,B57,B58,B74,B78,C20,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777108.1

376 aa

188

376

HGLS

PF07063 HGLS 79-334 aa

XP_057777109.1

370 aa

185

370

HGLS

PF07063 HGLS 79-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777108.1`	Pfam	`PF07063`	HGLS	Domain	79	334	6e-46	158.2	2-oxoadipate dioxygenase/decarboxylase
`XP_057777109.1`	Pfam	`PF07063`	HGLS	Domain	79	328	1.5e-47	163.5	2-oxoadipate dioxygenase/decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921126.1
TAATTTAAAGTAAATAGACAACAGCAGGGTATGGAATCTGTGAGGTGGAACGAAGTGTGAAAAACGTAAACTAATTCGAGTATTCTACGCAGTTTCTACAATGAACATGACACGAGGATTGACATTCATAACATCATATCAACTTCTGCAGACTCACAAGATAAGCCACAGAAAATTTCAATTTTTTTTAGAGAATCTATGAATACTATGCTCAAATTTCCACCTCCTTCTCTCCGATCTTGCGTTTCTCCATCGCCCTC...

XM_057921125.1
TAATTTAAAGTAAATAGACAACAGCAGGGTATGGAATCTGTGAGGTGGAACGAAGTGTGAAAAACGTAAACTAATTCGAGTATTCTACGCAGTTTCTACAATGAACATGACACGAGGATTGACATTCATAACATCATATCAACTTCTGCAGACTCACAAGATAAGCCACAGAAAATTTCAATTTTTTTTAGAGAATCTATGAATACTATGCTCAAATTTCCACCTCCTTCTCTCCGATCTTGCGTTTCTCCATCGCCCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995726
ATGAATACTATGCTCAAATTTCCACCTCCTTCTCTCCGATCTTGCGTTTCTCCATCGCCCTCATCTTCCTCTTCTCTTTCCCTTCCAAATCCCCCAAAATTCCACCCGATCAATATGATTTTCCATGGAAGAAAAAACAACATTAATTTTTCTAGCATCTCCGCATCGAGCAATCATCATGGACCTTCGCAAGATTCTTCCTTTCCGGGAAGGGAATCATTATTGAGGAATACATTGTCAGCTATGGAAACTGTTTATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777108.1
MNTMLKFPPPSLRSCVSPSPSSSSSLSLPNPPKFHPINMIFHGRKNNINFSSISASSNHHGPSQDSSFPGRESLLRNTLSAMETVYLNRNPTAKRILELVHSAENGHICYDHFAFRTFGVNDHGIGSIARFFMDFGYVQREELRFPAKKLKAYWFSPPTVVGADAGAGVNGPLPRIFISELLVDQMTAETQKIIRKYTEMSGNGYMHSALASALGCLTWETPSFSEFQQLARESEYAAWTLVNGYALNHVTVSAHRLKSH...

XP_057777109.1
MNTMLKFPPPSLRSCVSPSPSSSSSLSLPNPPKFHPINMIFHGRKNNINFSSISASSNHHGPSQDSSFPGRESLLRNTLSAMETVYLNRNPTAKRILELVHSAENGHICYDHFAFRTFGVNDHGIGSIARFFMDFGYVQREELRFPAKKLKAYWFSPPTVVGADAGAGVNGPLPRIFISELLVDQMTAETQKIIRKYTEMSGNGYMHSALASALGCLTWETPSFSEFQQLARESEYAAWTLVNGYALNHVTVSAHRLKSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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