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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002721`

染色体: Chr07 坐标: 26702168-26706323 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002721`
名称	SmilChr07G002721
描述	subtilisin-like protease SBT4.13
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26702168 - 26706323 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995730`
GeneID	`130995730`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995730`
原始查询	`SmilChr07G002721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT4.13
产物	subtilisin-like protease SBT4.13
Arabidopsis	`AT5G59120` (SBT4.13) subtilase 4.13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836030] identity=53.4; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0278950` (OsSub1) - identity=38.7; qcov=1.08; evalue=5.44e-150; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995730

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057777114.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057777114.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057777114.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777114.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26703575`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B123,B130,B37,B52,B59,B68,B80,B86,B98,C48,C72,C86
`Chr7:26704274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:26704295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C57,D4
`Chr7:26704453`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	8	A11,B111,B126,B25,B46,B49,B79,C36
`Chr7:26704454`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A11,B111,B126,B25,B46,B49,B79,C36
`Chr7:26704744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B68,C48
`Chr7:26704857`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr7:26704857`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr7:26704869`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr7:26704869`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr7:26704872`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr7:26704872`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777114.1

736 aa

368

736

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 35-108 aa PF00082 Peptidase_S8 134-576 aa PF17766 fn3_6 631-730 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777114.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	35	108	6.5e-14	53.1	Peptidase inhibitor I9
`XP_057777114.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	134	576	4.9e-46	158.0	Subtilase family
`XP_057777114.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	631	730	1.7e-24	86.6	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921131.1
ATGATGGTGCTTATGAGTTGTGATTAATAAAATCACCAGCATTTTAAACAACCAGAGTAGCAGATTTCTGATTTAATGTTTCTCCTCCAATATGGAAGTTAATTTAATGGTAATTAGTGACTCAAAAAATTACAATATTTCTATCATAATTAGATCTAACCTGTCAAAAACAACTGGATTCATTTCTACAACCAGAAGAGTTCATAAACATTTAAGGTTAACATTGGAGTGAGCTTGAGAAATCTGGTCTCACAATCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995730
ATGAAAAATTTCTTTTCTCTTAGATCTTCCAACATTTTACTTGTTCTTGTTCTGGTTTTGAGCGACGCCCTTCACACTTTCGCAGCAGAAGAAGATAGACAGGTATACATTGTGTACATGGGAAATCTTGTTGAAAAAGATCGGTCTCTTTCATCGTACCATTTTAACATGCTTCAACAAGTTGTTGACAGCAGGTTTTTGAGACAATCCTTAGTTAGAAGTTACACAAGAAGTTTCAACGGGTTTGCAGCCTATCTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777114.1
MKNFFSLRSSNILLVLVLVLSDALHTFAAEEDRQVYIVYMGNLVEKDRSLSSYHFNMLQQVVDSRFLRQSLVRSYTRSFNGFAAYLTAQEHEKLASHEGIVSIFPSSSFYPETTRSWDFMGFHKNVHRNPTVESDTIIGVIDTGIWPESESFSDKGFSLLPKKWKGACKGGKNFTCNNKLIGARHYNSLPLPDDSSRDVVGHGTHTASIAAGNYVKHASFYGIARGTARGGVPSSRVAVYKVCHPDGCQSEDILAAFDDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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