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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002782`

染色体: Chr07 坐标: 27715652-27717604 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002782`
名称	SmilChr07G002782
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27715652 - 27717604 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995793`
GeneID	`130995793`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995793`
原始查询	`SmilChr07G002782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
产物	polyphenol oxidase I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0624500` (Ph=Bhc(Po)) - identity=42.72; qcov=0.926; evalue=1.85e-131; confidence=medium
GO	GO:0004097 (catechol oxidase activity); GO:0046148 (pigment biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00264 (Tyrosinase); PF12142 (PPO1_DWL); PF12143 (PPO1_KFDV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995793

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777200.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057777200.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057777200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27716062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B68
`Chr7:27716623`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B131
`Chr7:27716623`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B131
`Chr7:27716782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:27717123`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr7:27717123`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr7:27717167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:27717402`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr7:27717402`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr7:27717405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777200.1

564 aa

282

564

Tyrosinase

PPO1_DWL

PPO1_KFDV

PF00264 Tyrosinase 151-357 aa PF12142 PPO1_DWL 365-415 aa PF12143 PPO1_KFDV 440-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777200.1`	Pfam	`PF00264`	Tyrosinase	Domain	151	357	4.1e-34	119.6	Common central domain of tyrosinase
`XP_057777200.1`	Pfam	`PF12142`	PPO1_DWL	Domain	365	415	1.7e-23	82.8	Polyphenol oxidase middle domain
`XP_057777200.1`	Pfam	`PF12143`	PPO1_KFDV	Domain	440	557	6.8e-31	107.7	Chloroplastic Polyphenol Oxidase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921217.1
ACACTTAGAAATCACAACAGAAAACCATGGCCTCTCTTCAATCTTCATGCATGGTGCTCACCCACAACCGCATTTGTCCTCTAGTCAAGCCATCCCACCACTTTCCCAATGCAAGGCTAACTTATCGCTTTCACGTCTCATGCAGCAGCAACGGCGGCGTAGACCGCAGAAACATGCTCCTTGGGCTTGGAGGTTTGTACGGTGCAGCCAACCTCATCTCTGATTCCAAAGCTTACGCCGACCCCATTCAACCGCCGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057777200.1_38094
ATGGCCTCTCTTCAATCTTCATGCATGGTGCTCACCCACAACCGCATTTGTCCTCTAGTCAAGCCATCCCACCACTTTCCCAATGCAAGGCTAACTTATCGCTTTCACGTCTCATGCAGCAGCAACGGCGGCGTAGACCGCAGAAACATGCTCCTTGGGCTTGGAGGTTTGTACGGTGCAGCCAACCTCATCTCTGATTCCAAAGCTTACGCCGACCCCATTCAACCGCCGGATATCAAGAGTTGCGGTGTTGCAGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777200.1
MASLQSSCMVLTHNRICPLVKPSHHFPNARLTYRFHVSCSSNGGVDRRNMLLGLGGLYGAANLISDSKAYADPIQPPDIKSCGVADVHGDPLDVNCCPPNSDTIIDYELPSVTSLRVRPAAHKLNHGYLTKYEKAIQLMRELDKKDPSDPRGFTQQANVHCAYCNGAYDQVDYEGTDISIHYSWLFFPFHRWYLYFYERILGSLIGDPTFALPFWNWDNPRGMQLPAIFDNPHSPLYDINRNPSNRPPAIVDLALSGKTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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