当前解析结果
SmilChr07G002802| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002802 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002802 |
| 描述 | cytochrome P450 704B1 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 28009264 - 28011358 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995798 |
|---|---|
| GeneID | 130995798 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995798 |
| 原始查询 | SmilChr07G002802 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 704B1 |
| 产物 | cytochrome P450 704B1 |
| Arabidopsis | AT1G69500 (CYP704B1)cytochrome P450, family 704, subfamily B, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843283] identity=72.9; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0168600 (CYP704B2)- identity=67.6; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995798 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057777207.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057777208.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777207.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777207.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777207.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:28009432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:28009516 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:28009528 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B121,B25,B30,B85 |
Chr7:28010009 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:28010061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr7:28010892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777207.1PF00067
p450 27-500 aa
XP_057777208.1PF00067
p450 27-487 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777207.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 27 | 500 | 1.1e-67 | 229.6 | Cytochrome P450 |
XP_057777208.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 27 | 487 | 1.2e-57 | 196.5 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。