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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002876`

染色体: Chr07 坐标: 28954162-28956377 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002876`
名称	SmilChr07G002876
描述	heparanase-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28954162 - 28956377 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995863`
GeneID	`130995863`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995863`
原始查询	`SmilChr07G002876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heparanase-like protein 1
产物	heparanase-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G07830` (GUS2) glucuronidase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830676] identity=51.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0598400` - identity=56.1; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004566 (beta-glucuronidase activity); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00531 (Glycosaminoglycan degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03662 (Glyco_hydro_79n)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995863

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057777304.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057777304.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777304.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777304.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28954341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:28955040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,D10,D6
`Chr7:28955242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B119,B122,B81
`Chr7:28955296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B119,B122,B81
`Chr7:28955361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:28955412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:28955413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B119,B122,B81
`Chr7:28955637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B119,B122,B81
`Chr7:28955760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:28955858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B137,B26
`Chr7:28955877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:28955920`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777304.1

531 aa

266

531

Glyco_hydro_79n

PF03662 Glyco_hydro_79n 24-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777304.1`	Pfam	`PF03662`	Glyco_hydro_79n	Domain	24	348	2.7e-150	500.5	Glycosyl hydrolase family 79, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921321.1
ATGGAGTCTAAAGTGATAATTTGCAGCATTATTGTTTTATTGTTTACAAGTTTGTGTTGTGCAGAAGAAGTGAAAGTGATAGTAAAGGGTGTGACTTCCATAGCCAAAACAGATGAAAACTTTGTTTGTGCAACATTAGATTGGTGGCCTCATAATAAGTGTGACTACAATCAGTGCCCATGGGGAAATGCAGGCATTCTTAATCTGGATTTGGACAACAAGATTCTTGCAAATGCAATCAAGGCATTTAAATCACTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995863
ATGGAGTCTAAAGTGATAATTTGCAGCATTATTGTTTTATTGTTTACAAGTTTGTGTTGTGCAGAAGAAGTGAAAGTGATAGTAAAGGGTGTGACTTCCATAGCCAAAACAGATGAAAACTTTGTTTGTGCAACATTAGATTGGTGGCCTCATAATAAGTGTGACTACAATCAGTGCCCATGGGGAAATGCAGGCATTCTTAATCTGGATTTGGACAACAAGATTCTTGCAAATGCAATCAAGGCATTTAAATCACTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777304.1
MESKVIICSIIVLLFTSLCCAEEVKVIVKGVTSIAKTDENFVCATLDWWPHNKCDYNQCPWGNAGILNLDLDNKILANAIKAFKSLRIRVGGSLQDQVVYQVGKHANKCPHFKLNHKGLFGFTQGCLPMERWDRLNKLFNQTGALVTFSLNALAGRKKAAVPVEEDDEATLMVGKWDPRNAYDLIKYTASKGYKIDSYELGNELCGSGVSVRVEAEPYGKDMMTVKKMIKKLYPNGTTRPKLLGPGGFYEEEWFKTFLQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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