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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003333`

染色体: Chr07 坐标: 35668856-35670658 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003333`
名称	SmilChr07G003333
描述	uncharacterized SmilChr07G003333
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35668856 - 35670658 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994161`
GeneID	`130994161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994161`
原始查询	`SmilChr07G003333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0106100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0106100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G13200` (EMB2769) Cwf15 / Cwc15 cell cycle control family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820510] identity=69.9; qcov=0.981; evalue=9.21e-45; confidence=medium
Rice	`Os06g0106100` - identity=75; qcov=0.931; evalue=4.52e-67; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0045292 (mRNA cis splicing, via spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04889 (Cwf_Cwc_15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775177.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775177.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775177.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775177.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35668873`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B8,C48
`Chr7:35668873`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B8,C48
`Chr7:35668943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B75
`Chr7:35668959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B61,C2,C42
`Chr7:35669256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C69
`Chr7:35669288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B5,C9
`Chr7:35669453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C54,C61
`Chr7:35670140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:35670147`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A1,A16,A20,B110,B111,B119,B128,B129,B131,B15,B23,B26,B27,B28,B73,B94,B95,C25,C29,C31,C54,C56,C57,C61,C64,C66,C84,D10,D2
`Chr7:35670176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C3
`Chr7:35670197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr7:35670205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775177.1

159 aa

159

Cwf_Cwc_15

PF04889 Cwf_Cwc_15 1-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775177.1`	Pfam	`PF04889`	Cwf_Cwc_15	Family	1	148	2.5e-32	113.4	Cwf15/Cwc15 cell cycle control protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919194.1
ATTTGAAAGTATATAAAGACTAGTCATTCTTATCGAAATAGGCTGGCATTGCTTCGAGGCCGTCCCTCGGCCCATTAGAAGTATGTAAAAGCCCGGTCTATAGAATGTGGGCTGTTGGCCCATTAAGGGCGATCCGAGTCTGAGCCCGATCCCGTCTAAGGAGAAAGGGTTATAGTTGTAAATTGAGTTGTCGAGCTCTCTATTTCGTCCTTACCTTAGATTACATTATCCGTCTCCCACAGAAATTCCCAAATCGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994161
ATGACGACGGCGGCAAGACCTACGTGGGCACCCGCGAAAGGTGGGAATGAACAACGGGGAACTCGAATCTTCGGTCCATCTCAAAAGTATTCGTCGAGGGACATCGCTTCTCATACTACCCTCAAACCCAGAAAGGAAGGACAAGACACCCAAGACGAGGTGCAAAGGAGAAATCTCAGGGACGAGCTAGAGGATCGAGAGAGGAGGCATTTCTCATCAAAAGAGGATAGAGATCGCCGGAAAGGAAATCATCTTCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775177.1
MTTAARPTWAPAKGGNEQRGTRIFGPSQKYSSRDIASHTTLKPRKEGQDTQDEVQRRNLRDELEDRERRHFSSKEDRDRRKGNHLLLEGSRREVEDRIVPRSIDADDADVDAQSDDDSDDEDDDDGEEALLLELERLRKEKAEQKEREVSRVFFTFQDF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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