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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003462`

染色体: Chr07 坐标: 38649167-38652304 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003462`
名称	SmilChr07G003462
描述	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38649167 - 38652304 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992879`
GeneID	`130992879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992879`
原始查询	`SmilChr07G003462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase, chloroplastic-like
产物	glutamate-1-semialdehyde 2%2C1-aminomutase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G48730` (GSA2) glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824034] identity=80.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0532200` (GSA) - identity=80; qcov=0.945; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008483 (transaminase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding); GO:0033014 (tetrapyrrole biosynthetic process); GO:0042286 (glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase activity)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00202 (Aminotran_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773621.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057773621.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057773621.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773621.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38651112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B86
`Chr7:38651116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:38651244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B59,C59,D1
`Chr7:38651414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:38651425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:38651931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B129,B65,D6
`Chr7:38652014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773621.1

472 aa

236

472

Aminotran_3

PF00202 Aminotran_3 80-441 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773621.1`	Pfam	`PF00202`	Aminotran_3	Domain	80	441	1.5e-70	238.6	Aminotransferase class-III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917638.1
TGTAATTTGTGCTGCAAAGAATGGAATTACTGGGCCAGGTCCATCTTTTGCAACTACGAATGGAGTAATAATTTTATCTGAATTTCTTATCTTCTTCCAACTCAAGACATCGCAGCTAACAGATAGCTCTCCCCTCTCTTGCTTAGATCACCAACTCAACATCGCCTCCACCAAAATGGCGGCTGCAATTACCGGTCTAGCTGTGTCATGTCCGTCAAAATTGACTCAGGCTGTCGTCGCCGACCGCCGCTTCAGGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992879
ATGGCGGCTGCAATTACCGGTCTAGCTGTGTCATGTCCGTCAAAATTGACTCAGGCTGTCGTCGCCGACCGCCGCTTCAGGAGGCGGTCTGCCTCGGTCGTTCGGATGACTTTGCTTGAGGAGAAGAAGAAAACTTACACTCTCACCAAATCCGAGGAGGCTTTTAAGGCTGCCAAGGAATTGATGCCTGGAGGTGTGAATTCCCCTGTCCGTGCTTTCAAATCAGTTGGTGGTCAGCCAATTGTTATTGATTCTGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773621.1
MAAAITGLAVSCPSKLTQAVVADRRFRRRSASVVRMTLLEEKKKTYTLTKSEEAFKAAKELMPGGVNSPVRAFKSVGGQPIVIDSVKGSHMWDIDGNEYIDYVGSWGPAIIGHADDEVLAALAETMKKGTSFGAPCLLENVLAEMVISAVPSIEMVRFVNSGTEACMGVLRLARAFTGREKIIKFEGCYHGHADPFLVKAGSGVATLGLPDSPGVPKAATFTTLTSPYNDISTVESLFETNKGEIAAVILEPVVGNAGFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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