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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003630`

染色体: Chr07 坐标: 42883060-42890052 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003630`
名称	SmilChr07G003630
描述	lysine-specific demethylase JMJ13-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	42883060 - 42890052 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993113`
GeneID	`130993113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993113`
原始查询	`SmilChr07G003630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-specific demethylase JMJ13-like
产物	lysine-specific demethylase JMJ13-like
Arabidopsis	`AT5G46910` (AT5G46910) Transcription factor jumonji (jmj) family protein / zinc finger (C5HC2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834736] identity=57.8; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0577600` (JMJ706) - identity=49.8; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0032452 (histone demethylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02373 (JmjC); PF02375 (JmjN); PF02928 (zf-C5HC2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773848.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773848.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773848.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773848.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773848.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:42885699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:42886045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:42886052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:42886507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:42886900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B93,C82
`Chr7:42887309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D11
`Chr7:42887430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:42887669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:42887673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82
`Chr7:42887792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D8
`Chr7:42887916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B57
`Chr7:42888287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773848.1

826 aa

413

826

JmjN

JmjC

zf-C5HC2

PF02375 JmjN 101-133 aa PF02373 JmjC 277-400 aa PF02928 zf-C5HC2 498-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773848.1`	Pfam	`PF02375`	JmjN	Family	101	133	5.8e-16	58.7	jmjN domain
`XP_057773848.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	277	400	2.2e-39	135.2	JmjC domain, hydroxylase
`XP_057773848.1`	Pfam	`PF02928`	zf-C5HC2	Domain	498	549	3e-08	34.6	C5HC2 zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917865.1
TTCCCCCCCTTTTATCCTTTTCGCTAAAATATTGTATTTTACGTAATTATTAAACTCTTTTATTCGTTTCCAAATTGGCACTCTTCGCTGTAATTGCTTTATTTAATGAAAATTGGTAATTATTAACGAATTTGTTGGGACAGTACTTATTGAAACTATAATCGATAAATCATCCCTCCTTTTACAATTTTCAGTTTTCCTAACCCCTTGCAACTTCAAGTTTCTCTCTCTACAGCTCTCTCTCTCCGCGTCTCTCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993113
ATGGTGGAGGGAAGAGTTTGTTCTTCTAGAGAAGCTAAACTGGAATTTTTAAAGCATAAAATGCTAAAAAGGAGGAAAACAGAAACAGAGAATGAATCTTATGTTGTTAGCAAGACCCTGAATAGGAGTGGTGGTGATGCTTTACGAACTTCTGCTCCTTGTGGTGTTAGTTTGCACAATCATGCTGGCCTATATTCAAGATTTGGCAACAGTTCCACTGAGAAAGATGTTTTCTCAAAGAGAAAAGTGGCTAAGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773848.1
MVEGRVCSSREAKLEFLKHKMLKRRKTETENESYVVSKTLNRSGGDALRTSAPCGVSLHNHAGLYSRFGNSSTEKDVFSKRKVAKFDTSNLEWTEKVPECPVYCPTKEEFQNPLVYIQKIAPEASKYGICKIISPVHASVPAGVVLTKEKAGFSFTTRVQPLRFAEWDSDDKVTFFMSGINYSFRDFERMANKIFARRYGSVGGLPAAFMEKEFWNEIACGKTESVEYACDVDGSAFSSSPNDPLGKSRWNLKKIPRLPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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