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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003758`

染色体: Chr07 坐标: 45857706-45859657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003758`
名称	SmilChr07G003758
描述	chlorophyllase-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	45857706 - 45859657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992773`
GeneID	`130992773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992773`
原始查询	`SmilChr07G003758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyllase-1-like
产物	chlorophyllase-1-like
Arabidopsis	`AT1G19670` (CLH1) chlorophyllase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838554] identity=41; qcov=1.02; evalue=1.06e-72; confidence=medium
Rice	`Os10g0419600` (OsCHL) - identity=40.1; qcov=1.06; evalue=1.89e-69; confidence=medium
GO	GO:0015996 (chlorophyll catabolic process); GO:0047746 (chlorophyllase activity)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03403 (PAF-AH_p_II); PF07224 (Chlorophyllase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057773508.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057773508.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057773508.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773508.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:45857915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B47
`Chr7:45857928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr7:45858135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B27,B50,B57
`Chr7:45858241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:45858331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:45858371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B17,B73,C30
`Chr7:45859266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:45859304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773508.1

312 aa

156

312

Chlorophyllase

PAF-AH_p_II

PF07224 Chlorophyllase 19-309 aa PF03403 PAF-AH_p_II 53-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773508.1`	Pfam	`PF07224`	Chlorophyllase	Family	19	309	2.4e-108	362.2	Chlorophyllase
`XP_057773508.1`	Pfam	`PF03403`	PAF-AH_p_II	Domain	53	89	1.3e-07	31.2	Platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917525.1
CAATCGTCCGGTAGCCTTTGACCCCATCTATCATTTCCCTTTAGCCTAATTAAGTAAACTCCATTTGAATGCCTAACTTTGAAATTCCATTCAAAAGCTCCAAACTTAATTTGTTAAAAAGCCATTTCGCGGAGGATTTTACGAGTCAAAATTGCATTCCAATTCCACTTACTCATGATATATATATATATATATAGGAGCAAATAAGTTATGGTCTCATGCAAAAAACAATCATGGAAATGAAAATGCAGGTTGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992773
ATGCAAAAAACAATCATGGAAATGAAAATGCAGGTTGAAAATGAAAAAGAGATTGGTAGTGTGTTCGAGGCCGGAAATCTAAGCGTGAAAACTATGAAAGTGAAGAAATCAGATGGTTGTCGGCCGCCGGCGGAGGTGCTGGTGGTGGCGCCGGAGGCACAAGGCAGGTACCCGCTTGTGCTCTTCTGCCATGGTTACTGCACTCAAACTAGTTGGTATTCTCAACTCCTCTGCCATATATCTTCCCATGGATACATACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773508.1
MQKTIMEMKMQVENEKEIGSVFEAGNLSVKTMKVKKSDGCRPPAEVLVVAPEAQGRYPLVLFCHGYCTQTSWYSQLLCHISSHGYILVAPKLYQWLLICKNDEIKTAGNVANWVARGGLETCLPENVKPDLSKTAVMGHSRGGRTAFGLALGHRHLAFKALIGLDPVEGPAPAAWVEPRILSYVPRSFNAGMPVAVVGGGLGNRSKGVFVPPLAPDGCSHAEFFNESRPPCCYFVAKDYGHCDVLDEERAGLGGLVCRSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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