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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003845`

染色体: Chr07 坐标: 47646594-47653604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003845`
名称	SmilChr07G003845
描述	vacuolar-processing enzyme
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	47646594 - 47653604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992841`
GeneID	`130992841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992841`
原始查询	`SmilChr07G003845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar-processing enzyme
产物	vacuolar-processing enzyme
Arabidopsis	`AT1G62710` (BETA-VPE) beta vacuolar processing enzyme [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842569] identity=70; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0644000` (OsVPE3) - identity=63.6; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0006624 (vacuolar protein processing); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01650 (Peptidase_C13); PF20985 (Legum_prodom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057773583.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057773583.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057773583.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773583.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:47646733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B67
`Chr7:47646760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B119,C31
`Chr7:47651275`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B10
`Chr7:47651275`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B10
`Chr7:47651378`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A11,A24,B112,B121,B124,B129,B46,B71,B80,B98,C16,C46,C48
`Chr7:47651394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:47651945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:47651987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:47652013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B27,B50,B57
`Chr7:47652044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C67,C69
`Chr7:47652998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:47653008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773583.1

469 aa

234

469

Peptidase_C13

Legum_prodom

PF01650 Peptidase_C13 40-311 aa PF20985 Legum_prodom 361-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773583.1`	Pfam	`PF01650`	Peptidase_C13	Domain	40	311	9.3e-119	396.4	Peptidase C13 family
`XP_057773583.1`	Pfam	`PF20985`	Legum_prodom	Domain	361	456	8e-38	129.3	Legumain, prodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917600.1
TGCTGGCACAGGTGTCGCTCCCTTGTTCTGCATGGCCGAGCAGGCCGCTTTGCACTCACTACAAAACACGCGCAAATTCATCGATTAGCGTTAATTCAGGATGACTCTTTGTGGGATTTTGGTGCTGCTTGTGTCGGTGGCGGCGCTGGCCCTTCAAGGCGTCGGAGCACGGCGGTGGGATCCCATCATACGGCGGCCGACGGAGGAGAACGCCACCACGTGGGCGGTGCTGGTGGCGGGTTCTAATGGCTTTGGAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992841
ATGACTCTTTGTGGGATTTTGGTGCTGCTTGTGTCGGTGGCGGCGCTGGCCCTTCAAGGCGTCGGAGCACGGCGGTGGGATCCCATCATACGGCGGCCGACGGAGGAGAACGCCACCACGTGGGCGGTGCTGGTGGCGGGTTCTAATGGCTTTGGAAATTATCGGCATCAGGCCGACGTTTGCCATGCATACCAACTACTCAAAAGGGGTGGCATCAAAGATGAGAACATTGTAGTTTTCATGTATGATGACATTGCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773583.1
MTLCGILVLLVSVAALALQGVGARRWDPIIRRPTEENATTWAVLVAGSNGFGNYRHQADVCHAYQLLKRGGIKDENIVVFMYDDIAMNDLNPRKGVLINHPTGEDVYAGVPKDYTGEQVTAENFYAVILGNRSAVKGGSGKVVDSKPGDRIFIYYSDHGGPGVLGMPNMPYLYAKDFIDVLKKKHESGTYKEMVIYIEACESGSVFEGMMPEDLDIYVTTASNAEESSWGTYCPGMDPPPPPEYMTCLGDLYSVAWMEDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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