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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003906`

染色体: Chr07 坐标: 49244659-49249248 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003906`
名称	SmilChr07G003906
描述	probable aminotransferase ACS10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49244659 - 49249248 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994608`
GeneID	`130994608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994608`
原始查询	`SmilChr07G003906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aminotransferase ACS10
产物	probable aminotransferase ACS10
Arabidopsis	`AT1G62960` (ACS10) ACC synthase 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842598] identity=55.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0130400` (SSG6) - identity=55.2; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004069 (L-aspartate:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008793 (aromatic-amino-acid:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057775647.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057775647.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057775647.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775647.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49245144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B136,B19,B21,C26
`Chr7:49245337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B136,B19
`Chr7:49245344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:49245350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C11,C67,C69
`Chr7:49245442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:49245445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:49245460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C26
`Chr7:49245526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:49245541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:49245715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:49245793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B79,B83,C59
`Chr7:49245937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C11,C67,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775647.1

530 aa

265

530

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 142-520 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775647.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	142	520	3.5e-65	221.3	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919664.1
GGCAAATTCAACCGCGCAAAACTCATCAAACAAACAAAACCTAAAAATCTTCTGCTTAAAATGCTTTTCCTCATGAATTTTGTCCAAACGCGACACAAAATAGAAACAAAAAAAAATAAGTACTACATAAAAATATCAGCCACCATTCTTCTCCTTCACTCACTCTTGAGAGAGGAAGCAATAAATTTATTCATTACTCAATCCTTGTAGTCTTGCATAGTACACTCCGTCGCTCTCGTGCTGGTGGGGTTCGGCGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994608
ATGAGAAAGGCCCGAAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCACCACCACCACAGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGGGCTGCGGCGGGGATGCGGGTGATAGTGCCCTTACAAGGGGTGGTGCAGGGGAGCGGCGGCCTTGTCCTGGGCTCGGTCATCCCCTGCGCCCTCTTCTACTTTCTCCAGCTCTATCTCAAGGGCCGCGGCCGGGGAGGCGGCCGCGCTCCGCCGCCGGAGGTTGAAGCTCCTTCGCCGCCGTCTGGGCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775647.1
MRKARNPSSSSSTTTTAGGGGGGAAAGMRVIVPLQGVVQGSGGLVLGSVIPCALFYFLQLYLKGRGRGGGRAPPPEVEAPSPPSGLQRVHSRALLSPRAPGGPAAVSSRANAIVRQREGPYYEGLKRAEEDIFDEVENPNGVIQLCSTENRLLWDIVQDWLTDHTTRLITGEELSITGITSYQPFDGLKELKTAVAGFMCQVVGRPLFSNPAQLVLTAGTAPAVEILVFSLADPGNAFLVPSPYCPDLDGDIKWRTGVEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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