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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004188`

染色体: Chr07 坐标: 53903475-53906398 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004188`
名称	SmilChr07G004188
描述	uncharacterized SmilChr07G004188
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53903475 - 53906398 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994945`
GeneID	`130994945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994945`
原始查询	`SmilChr07G004188`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0228300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0228300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G24570` (AT3G24570) Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822053] identity=66.3; qcov=0.874; evalue=3.23e-80; confidence=high
Rice	`Os01g0228300` - identity=66.5; qcov=0.926; evalue=2.33e-80; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04117 (Mpv17_PMP22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776125.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057776125.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057776125.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057776127.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057776127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53904120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:53904881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:53904894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B2
`Chr7:53905487`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	96	A13,A14,A18,A22,A23,A25,A7,A8,A9,B10,B103,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B114,B118,B12,B123,B124,B125,B129,B131,B135,B136,B138,B15,B18,B19,B22,B23,B3,B30,B31,B37,B4,B46,B47,B48,B5,B58,B60,B61,B63,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B77,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B95,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C16,C18,C20,C24,C27,C34,C36,C40,C42,C43,C44,C47,C49,C55,C61,C65,C7,C70,C73,C76,C79,C81,C82,C87,D11,D3,D4,D8
`Chr7:53905492`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	96	A13,A14,A18,A22,A23,A25,A7,A8,A9,B10,B103,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B114,B118,B12,B123,B124,B125,B129,B131,B135,B136,B138,B15,B18,B19,B22,B23,B3,B30,B31,B37,B4,B46,B47,B48,B5,B58,B60,B61,B63,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B77,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B95,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C16,C18,C20,C24,C27,C34,C36,C40,C42,C43,C44,C47,C49,C55,C61,C65,C7,C70,C73,C76,C79,C81,C82,C87,D11,D3,D4,D8
`Chr7:53905516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A18,A2,A21,A6,B105,B127,B136,B139,B15,B16,B20,B41,B49,B5,B56,B62,B66,B84,B96,C30,C32,C44,C68,C83
`Chr7:53906099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776125.1

212 aa

106

212

Mpv17_PMP22

PF04117 Mpv17_PMP22 126-186 aa

XP_057776127.1

190 aa

190

Mpv17_PMP22

PF04117 Mpv17_PMP22 104-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776125.1`	Pfam	`PF04117`	Mpv17_PMP22	Family	126	186	2.1e-19	70.0	Mpv17 / PMP22 family
`XP_057776127.1`	Pfam	`PF04117`	Mpv17_PMP22	Family	104	164	1.9e-19	70.2	Mpv17 / PMP22 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920142.1
TGAATTGACTAGGAATACGATAGACATAGATACTTAGGTAGAGATAGATTATAGATACAGAGAGATATAGAGAGAGAAAGGGAGGAGAGAGAGAATCCGAAACCCACCTTTGTTCCCCTTCCCCCGACTCCCTACTCAAATATCTTTGAACACAATCGCTTTTGAAAAAAAAAACCCTTGGATTAAACTGATTGAATTAACAGGAAAAGCATGTTGAGATTGTGGAAATGGTACCAGAATTGTTTAGCGACGCATCCAGT...

XM_057920144.1
TTTACTGCTGTGTTTGCATGTTGATAATTTTGGTTTGCGATCGGATTGTTTTGATGATAAAATGGCTATCATTTCCCTTTTTATGTGGTTTTGTTTATTTGTATTAGTTGATTTGTATATATTTGAGGGAAGGATTGGTCCGAAACTTTGGGAATTTATGGTACAGTTTTGTATATGTTCTTTTCCTAGCCGGTCCTAGTAAAGAAAACTTTTGTAGTGTTTGTCGTTGTAGGTTGTTCGGCTACTTGAGACCGATTTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994945
ATGTTGAGATTGTGGAAATGGTACCAGAATTGTTTAGCGACGCATCCAGTTAAAACCCAGGTGATTAGCTCCGGCTTCATTTGGGGGTTGGGCGATATTGCAGCTCAAGCCGTCACTCACTCCACCGCCAAGCCGCAAAAGCATGATGAACATAAAGAATTAAAGATCAATTGGAGACGAGTAGCCACCACAACCATATTTGGTCTTGGATTTGTTGGTCCCGTTGGCCACTACTGGTATGAAGCGCTGGACCGTGTCAT...

LOC130994945
ATGCTATTGTTTGACAGCATATCTATGATAGTGAAGCAATGGGGTATCTCTATTTGGAGGTTTTTCCCTCATCATCTGGATGAACATAAAGAATTAAAGATCAATTGGAGACGAGTAGCCACCACAACCATATTTGGTCTTGGATTTGTTGGTCCCGTTGGCCACTACTGGTATGAAGCGCTGGACCGTGTCATTAGGGTGCGGCTAAAGCTACAGCCAAATTCCTTCCGTTTTGTCGCTTCAAAAGTAGCAGCTGATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776125.1
MLRLWKWYQNCLATHPVKTQVISSGFIWGLGDIAAQAVTHSTAKPQKHDEHKELKINWRRVATTTIFGLGFVGPVGHYWYEALDRVIRVRLKLQPNSFRFVASKVAADGIIFGPVDLLVFFTYMGFSSGKSSAQVKDDVKRDFLPALILEGAIWPAVQVANFRFVPVRNQLLYVNFFCLLDSCFLSWVEQQQDAPWKQWLKSSLSFKEGQGG

XP_057776127.1
MLLFDSISMIVKQWGISIWRFFPHHLDEHKELKINWRRVATTTIFGLGFVGPVGHYWYEALDRVIRVRLKLQPNSFRFVASKVAADGIIFGPVDLLVFFTYMGFSSGKSSAQVKDDVKRDFLPALILEGAIWPAVQVANFRFVPVRNQLLYVNFFCLLDSCFLSWVEQQQDAPWKQWLKSSLSFKEGQGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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