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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004320`

染色体: Chr07 坐标: 55755417-55758736 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004320`
名称	SmilChr07G004320
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55755417 - 55758736 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994942`
GeneID	`130994942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994942`
原始查询	`SmilChr07G004320`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
产物	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G11770` (AT5G11770) NADH-ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831049] identity=78.5; qcov=1.02; evalue=1.6e-120; confidence=high
Rice	`Os01g0720300` - identity=90.4; qcov=0.758; evalue=4.78e-114; confidence=high
GO	GO:0005747 (GO:0005747); GO:0008137 (NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity); GO:0009060 (aerobic respiration); GO:0015990 (electron transport coupled proton transport); GO:0032981 (mitochondrial respiratory chain complex I assembly); GO:0045272 (GO:0045272); GO:0048038 (quinone binding); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01058 (Oxidored_q6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776122.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057776122.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057776122.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776122.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776122.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55755799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D9
`Chr7:55755821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr7:55755970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:55758354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776122.1

219 aa

110

219

Oxidored_q6

PF01058 Oxidored_q6 94-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776122.1`	Pfam	`PF01058`	Oxidored_q6	Domain	94	203	3.8e-28	98.5	NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920139.1
GTGAATTGTGATTCACATCAAAGGAATTAATAGTCGGTTACGATAGAAAATAGGGGAGACTAAGGAGCAAATGGACGAAATTACCCCTACATATCTTTAACATAAGCCCCCAACCCATCTTCTGCCTCAGTTAATTTCTTCACAAATTCGAATCGAAAAAAAGGGTCACAAAGGAAAGGGTAAAAATGGCTCAGCTAGCCAGAAATGCAGCTCGTCTACTCCCTCAAACGGCGCCGTTTCACCACCGGGCCGCCCTCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994942
ATGGCTCAGCTAGCCAGAAATGCAGCTCGTCTACTCCCTCAAACGGCGCCGTTTCACCACCGGGCCGCCCTCGCTTCGATCCACACCACCACCCCCTCCCTCGCCGCCGCCGCTTCCTCCTCCTCCTCCACGCCGACGCCCTACACGCCCTCCCTCCCGCCGTCGGGCTCCTCGCCGCCGGGGATGTCCAAGGCGGCGGAGTTCGTGATCTCGAAGGTCGACGATGTCATGAACTACGTCCGCCGCGGCTCCATCTGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776122.1
MAQLARNAARLLPQTAPFHHRAALASIHTTTPSLAAAASSSSSTPTPYTPSLPPSGSSPPGMSKAAEFVISKVDDVMNYVRRGSIWPMTFGLACCAVEMMHTGAARYDLDRFGIIFRPSPRQSDCMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRWVISMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDIYVPGCPPTAEALLYGLLQLQKKINRRRDFYHWWTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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