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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000055`

染色体: Chr08 坐标: 333032-336292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000055`
名称	SmilChr08G000055
描述	polygalacturonase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	333032 - 336292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996987`
GeneID	`130996987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996987`
原始查询	`SmilChr08G000055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase-like
产物	polygalacturonase-like
Arabidopsis	`AT2G43890` (AT2G43890) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818993] identity=52; qcov=0.939; evalue=1.33e-132; confidence=high
Rice	`Os01g0623600` (OsPGL32) - identity=44.5; qcov=0.949; evalue=1.44e-104; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057778250.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057778250.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778250.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778250.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778250.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:333032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B60
`Chr8:333083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:333099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B131,B52,B72,C71
`Chr8:333160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:333256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr8:334355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B140,B60
`Chr8:334417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A7,B125,B35,C76
`Chr8:334943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:334952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B2,B46,B66,C23
`Chr8:334958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:334973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C16,C27,C30,C33
`Chr8:334994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778250.1

393 aa

196

393

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 28-278 aa PF00295 Glyco_hydro_28 55-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778250.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	28	278	3.7e-13	50.5	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057778250.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	55	374	2.2e-88	297.2	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922267.1
ATGCCTAAGTTAGCAACATTCACTAAGCCATTTTTTATTGTATTGATTGCAACATTATTGCATACATGCATTGCTAAATCATACAACGTTGTTGATTTCGGGGCGAAGGCCAATGGCAAGACGGACTCGTCACCGGCCTTCATGAAGGCGTGGGCGGCCGCCTGCAGCTCAAACGAGGATTCAACGGTGCTCGTGCCCTCGGGAACGTTCATGTCGAATTCGGTATCGTTCAACGGAACATGCAAGAAGGAAATGCGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996987
ATGCCTAAGTTAGCAACATTCACTAAGCCATTTTTTATTGTATTGATTGCAACATTATTGCATACATGCATTGCTAAATCATACAACGTTGTTGATTTCGGGGCGAAGGCCAATGGCAAGACGGACTCGTCACCGGCCTTCATGAAGGCGTGGGCGGCCGCCTGCAGCTCAAACGAGGATTCAACGGTGCTCGTGCCCTCGGGAACGTTCATGTCGAATTCGGTATCGTTCAACGGAACATGCAAGAAGGAAATGCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778250.1
MPKLATFTKPFFIVLIATLLHTCIAKSYNVVDFGAKANGKTDSSPAFMKAWAAACSSNEDSTVLVPSGTFMSNSVSFNGTCKKEMRLQILGNIVAPSYESLSDHQVWIGFYFVSRLSIIGGTIDAKGSSYWSCKRSKKDCPYGARSIALQSCKHVLVSGLKSFNSEGVHLHLNGCNNVTMQNLTLTAPGDSPNTDGIHIGNSDLVRVLHSTIGTGDDCISIGPGSTNMWVDNVAYGPGHGISIGSIGGTPKEAGVEHIVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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