当前解析结果
SmilChr08G000273| 统一基因 ID | SmilChr08G000273 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000273 |
| 描述 | pheromone-processing carboxypeptidase KEX1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 1861645 - 1863775 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997051 |
|---|---|
| GeneID | 130997051 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130997051 |
| 原始查询 | SmilChr08G000273 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pheromone-processing carboxypeptidase KEX1-like |
| 产物 | pheromone-processing carboxypeptidase KEX1-like |
| 拟南芥 | AT5G44040 (AT5G44040)eisosome SEG2-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834427] identity=29.43; qcov=0.894; evalue=3.86e-09; confidence=low |
| 水稻 | Os04g0511700- identity=30.08; qcov=0.608; evalue=2.82e-07; confidence=low |
| GO | GO:0007142 (male meiosis II) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997051 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质 | 1.00000 | XP_057778313.1 |
| 2 | 细胞核 | 0.20000 | XP_057778313.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:1863231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B15,B38,B76,B86,C20 |
Chr8:1863263 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:1863397 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr8:1863471 |
ATG |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | B20,C26,C51,C57 |
Chr8:1863479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr8:1863667 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B18,B3,B58,B72,C66 |
Chr8:1863667 |
TCA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B18,B3,B58,B72,C66 |
Chr8:1863668 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B114,B12,B89,C47,C78 |
Chr8:1863698 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B18,B3,B58,B72,C66 |
Chr8:1863698 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B18,B3,B58,B72,C66 |
Chr8:1863729 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C80 |
Chr8:1863729 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。