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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G000312

染色体: Chr08 坐标: 2191697-2196787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G000312
名称SmilChr08G000312
描述pentatricopeptide repeat-containing protein At2g17210
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向2191697 - 2196787 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130999904
GeneID130999904
locus_tag-
NCBI 名称LOC130999904
原始查询SmilChr08G000312

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述pentatricopeptide repeat-containing protein At2g17210
产物pentatricopeptide repeat-containing protein At2g17210
拟南芥AT2G17210 (AT2G17210)
Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816226]
identity=49.45; qcov=0.949; evalue=0.0; confidence=high
水稻Os09g0251500
-
identity=34.76; qcov=0.879; evalue=5.68e-132; confidence=low
GOGO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0009451 (RNA modification)
KEGG-
PfamPF01535 (PPR); PF12854 (PPR_1); PF13041 (PPR_2); PF20431 (E_motif)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130999904

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 线粒体 1.00000 XP_057781579.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:2192790 C CTA 2bp_insertion frameshift_variant 44 A18,A24,A25,A6,B10,B105,B113,B126,B128,B130,B134,B16,B18,B34,B36,B49,B57,B61,B64,B65,B69,B82,B85,B88,B90,B92,B95,B99,C30,C31,C47,C5,C50,C51,C52,C59,C60,C75,C81,C87,C9,D1,D4,D6
Chr8:2192834 C CT 1bp_insertion stop_gained,frameshift_variant 2 B94,C57
Chr8:2192834 C CT 1bp_insertion CDS_variant 2 B94,C57
Chr8:2192852 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B104
Chr8:2192870 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C57
Chr8:2192935 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B13
Chr8:2192963 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A23,B112,C19,C77
Chr8:2192965 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A22,B42,B43,C15
Chr8:2193045 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B103,B127,B129,B13,B36
Chr8:2193080 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B104,B38,B39,B85
Chr8:2193081 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B20,C17,C18,C29,C82
Chr8:2193118 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781579.1
762 aa
N
1
381
762
PPR
PPR
PPR
PPR
PPR
PPR
PPR_1
PPR
PPR_2
PPR
PPR
PPR
E_motif
C
PF01535 PPR 115-140 aa PF01535 PPR 143-173 aa PF01535 PPR 243-270 aa PF01535 PPR 317-343 aa PF01535 PPR 345-375 aa PF01535 PPR 418-441 aa PF12854 PPR_1 442-472 aa PF01535 PPR 446-474 aa PF13041 PPR_2 541-590 aa PF01535 PPR 544-574 aa PF01535 PPR 583-604 aa PF01535 PPR 616-640 aa PF20431 E_motif 658-719 aa
XP_057781580.1
733 aa
N
1
366
733
PPR
PPR
PPR
PPR
PPR
PPR
PPR_1
PPR
PPR_2
PPR
PPR
PPR
E_motif
C
PF01535 PPR 86-111 aa PF01535 PPR 114-144 aa PF01535 PPR 214-241 aa PF01535 PPR 288-314 aa PF01535 PPR 316-346 aa PF01535 PPR 389-412 aa PF12854 PPR_1 413-443 aa PF01535 PPR 417-445 aa PF13041 PPR_2 512-561 aa PF01535 PPR 515-545 aa PF01535 PPR 554-575 aa PF01535 PPR 587-611 aa PF20431 E_motif 629-690 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 115 140 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 143 173 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 243 270 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 317 343 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 345 375 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 418 441 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF12854 PPR_1 Repeat 442 472 6.9e-36 122.4 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 446 474 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF13041 PPR_2 Repeat 541 590 1.9e-65 217.5 PPR repeat family
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 544 574 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 583 604 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 616 640 4.4e-63 205.9 PPR repeat
XP_057781579.1 Pfam PF20431 E_motif Repeat 658 719 2.4e-10 41.2 E motif
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 86 111 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 114 144 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 214 241 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 288 314 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 316 346 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 389 412 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF12854 PPR_1 Repeat 413 443 4.1e-36 123.1 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 417 445 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF13041 PPR_2 Repeat 512 561 1.1e-65 218.2 PPR repeat family
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 515 545 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 554 575 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF01535 PPR Repeat 587 611 2.2e-63 206.9 PPR repeat
XP_057781580.1 Pfam PF20431 E_motif Repeat 629 690 2.2e-10 41.3 E motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057925597.1
CTTCTTCTACAATTATCAGATAAAATTCAATGCCACACAATTTTTTGGGTGTTACCCGTATTAAATTATTATATCTATTATTTTAATAATATTTTTTATAAGAATCAAAATTTATTATAATATAATGAATTATATTGAACTTTAATTCAAAAAATTATATACTGTAACTTTGAATTTATTACTGCGGCTCCAAGTTTCTCGAGTCAAATAAATTGATTACTGCGGCCGGAGATACATCTCCGGCGACATCTCGACGGCGG...
XM_057925596.1
TCACTGATTGCTATGATTTCGTGGTCAATGAAACTTGGTTACTTCTATCGTTATTGTAGCCCATAAACATGGCATAAGCATTTTGCTTTGCTACGTCGCTGCACTTTTGCACACCATGTGTTTGTTTTTATGTCTGAAAGAGCTATTTGTGCATAGGGCAAATGAGACGAGCTGAGTTGAATAATTCGGGTGTTCGAGCATGGCTCGAGTTTCTGTGTTGTTGATCGAGCTCAGCTCGTGTGCTACTCGCTCGAACTCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781579.1_40572
ATGTTATTGAGCTGTAGAAAGAAGTTGCAAAGATTCTATATATGTCTAGGTCCTACTCCTCTATGCTTCAAAATTCCCTCTAAGGATATGAGAAGCCCTGCCATTTCATCGGTGACGAATCTCCAAAATCTTTGTCACAAAATCAAAGAGTCATCATCAGTTTGCAGATGGAAGGAAGTGCTTTCCCATTACATAGAGATAAGGAAGGCCGGATTTCAACTGATAGATCACACAGTCTACTCTCATGTGCTCAAGGCTTG...
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781580.1_40573
ATGAGAAGCCCTGCCATTTCATCGGTGACGAATCTCCAAAATCTTTGTCACAAAATCAAAGAGTCATCATCAGTTTGCAGATGGAAGGAAGTGCTTTCCCATTACATAGAGATAAGGAAGGCCGGATTTCAACTGATAGATCACACAGTCTACTCTCATGTGCTCAAGGCTTGCTTACCTTTCTCATTTAGGCTCGGACAGTCCGTCCACGCATCCTTGACTAAGCAGGGATTCGACTCGTTCAGCTCTGTGAGAAACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057781579.1
MLLSCRKKLQRFYICLGPTPLCFKIPSKDMRSPAISSVTNLQNLCHKIKESSSVCRWKEVLSHYIEIRKAGFQLIDHTVYSHVLKACLPFSFRLGQSVHASLTKQGFDSFSSVRNSLMDFYAKSGVLSCAFSVFDCMKTRDSVSWNIILHGHLDRGFLEEGVDLFVEARAFGFQPNVSTLVLVIQAYQSLRAFDDGQGFHGYLIRSGLWSLTSVQNSLLGMYTEIRMDYAEILFDEMYEKDVISWSVMIRGYVHQNENVF...
XP_057781580.1
MRSPAISSVTNLQNLCHKIKESSSVCRWKEVLSHYIEIRKAGFQLIDHTVYSHVLKACLPFSFRLGQSVHASLTKQGFDSFSSVRNSLMDFYAKSGVLSCAFSVFDCMKTRDSVSWNIILHGHLDRGFLEEGVDLFVEARAFGFQPNVSTLVLVIQAYQSLRAFDDGQGFHGYLIRSGLWSLTSVQNSLLGMYTEIRMDYAEILFDEMYEKDVISWSVMIRGYVHQNENVFALESFKQMVSEFGVEPDGQTMVTVLKGCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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