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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000528`

染色体: Chr08 坐标: 3850782-3852774 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000528`
名称	SmilChr08G000528
描述	protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3850782 - 3852774 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000118`
GeneID	`131000118`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000118`
原始查询	`SmilChr08G000528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 2-like
产物	protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 2-like
Arabidopsis	`AT5G22890` (AT5G22890) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832353] identity=49.2; qcov=1; evalue=5.19e-103; confidence=high
Rice	`Os08g0562300` - identity=51.1; qcov=0.99; evalue=4.91e-102; confidence=high
GO	GO:0010044 (response to aluminum ion); GO:0010447 (response to acidic pH)
KEGG	-
Pfam	PF12874 (zf-met); PF23115 (zf-C2H2_STOP2_3rd); PF23118 (zf-C2H2_STOP2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000118

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781870.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781870.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781870.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781870.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781870.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3851488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:3851498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:3851503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:3851551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B8,C40
`Chr8:3851578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:3851589`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B122,B133,B35,B5,B53,B69,B83,C54,C59,C64,C66
`Chr8:3851603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B8,C40
`Chr8:3851677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C43
`Chr8:3852253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B18
`Chr8:3852319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781870.1

310 aa

155

310

zf-met

zf-C2H2_STOP2_3rd

zf-C2H2_STOP2_C

PF12874 zf-met 171-190 aa PF23115 zf-C2H2_STOP2_3rd 215-249 aa PF23118 zf-C2H2_STOP2_C 280-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781870.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	171	190	0.00014	22.8	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057781870.1`	Pfam	`PF23115`	zf-C2H2_STOP2_3rd	Domain	215	249	6.2e-22	78.1	STOP2-like, C2H2-type zinc finger
`XP_057781870.1`	Pfam	`PF23118`	zf-C2H2_STOP2_C	Domain	280	309	8.3e-20	70.8	STOP2-like, C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925887.1
GCATTTGAGGGAGGTCTCAAGTGGTGATGAAAGTTGACTTAGCAGCCTATGGCCTCGCTCCCCTACACCGTCGTGCTCCTACACCAAGGGCAAATCCGATAATACCGACACGTTTGTGATACACGCGCTGATAGATCTCATTGATTGAGGCGCGGGCGCAGAGTATATCGTAGAACTCAGCTTCACTGGATAACTCCTCCTTTCTTTCTTCCCTTTTTTTAAGCTGGGTGCTAATAATGTCAGCTTAGCGATAATTGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000118
ATGATGACGAATCCTTGTTACCCTAATGGCCCTCAAAATCTACCAATTTACGAAGAAGTAATTGATCCGAATTCGTCGTCTCCGTCGACGAATCCGACGTCGTTTCTGTACAACCTGTCGCTGCTGAGGGATAAAGTGGAGGAGGTGCAATCGCTCGCCGCTATGATGGGGCAGCATCCGGCGTCAACGGCAATGGCGATATCGACGACGATGGGCACCTTGATTCAAGAGATCATCGTCACGGCATCGTCGCTCATGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781870.1
MMTNPCYPNGPQNLPIYEEVIDPNSSSPSTNPTSFLYNLSLLRDKVEEVQSLAAMMGQHPASTAMAISTTMGTLIQEIIVTASSLMFACQQVSLRPPSPAAFEVQHDAAVAGDHNWYSNCNNINEIHEFGGKIERVEEERGEEEEEDEEAARSYELVELQAADLLAKYTHYCQVCGKGFKRDANLRMHMRAHGDEYKSSAALSNPAKRAEGPRKYSCPQEGCRWNKKHARFQPLKSMICVKNHYKRSHCPKMYVCKRCNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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