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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000766`

染色体: Chr08 坐标: 5668993-5671114 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000766`
名称	SmilChr08G000766
描述	GTP-binding protein SAR1A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5668993 - 5671114 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000347`
GeneID	`131000347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000347`
原始查询	`SmilChr08G000766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding protein SAR1A-like
产物	GTP-binding protein SAR1A-like
Arabidopsis	`AT4G02080` (SAR2) secretion-associated RAS super family 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827368] identity=94.3; qcov=0.995; evalue=4.05e-136; confidence=high
Rice	`Os12g0560300` (OsARL1f) - identity=93.3; qcov=1; evalue=1.08e-135; confidence=high
GO	GO:0003400 (GO:0003400); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0016050 (vesicle organization); GO:0030127 (COPII vesicle coat); GO:0061024 (membrane organization); GO:0070863 (positive regulation of protein exit from endoplasmic reticulum); GO:0070971 (endoplasmic reticulum exit site)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc); PF09439 (SRPRB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782200.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057782200.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057782200.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057782200.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5669254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B14,B88
`Chr8:5669263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B140,B58,B89,C31
`Chr8:5669517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782200.1

193 aa

193

Arf

SRPRB

MMR_HSR1

Roc

Ras

PF00025 Arf 8-192 aa PF09439 SRPRB 19-145 aa PF01926 MMR_HSR1 22-130 aa PF08477 Roc 22-132 aa PF00071 Ras 22-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782200.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	8	192	1.6e-63	214.0	ADP-ribosylation factor family
`XP_057782200.1`	Pfam	`PF09439`	SRPRB	Domain	19	145	2.9e-08	34.0	Signal recognition particle receptor beta subunit
`XP_057782200.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	22	130	3.6e-07	31.0	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057782200.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	22	132	1.6e-08	35.5	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057782200.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	22	134	6.7e-07	29.7	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926217.1
TTATTGAATTTTAACAAAATTAAGCTCTAAACGAACACGTGAACCACAAATTCCAGGCAATTAATATTCCGACCCCTATCGCTCTCACTCCACCAAAATTCTCTCTCCACACACACTGCAACGAAAAACCAAAAACTACAGAGAAACACAAATTCATCACTAGGTTCCACTCCAGATCTACCGGAATCCCGCTCCGTACAAAATGTTTCTGTTGGATTGGTTTTACGGCGTGTTGGCGTCGCTCGGCTTGTGGCAGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000347
ATGTTTCTGTTGGATTGGTTTTACGGCGTGTTGGCGTCGCTCGGCTTGTGGCAGAAGGAGGCGAAGATCCTCTTTCTCGGCCTCGATAATGCCGGAAAAACCACGCTTCTTCATATGCTCAAGGACGAGAGATTAGTGCAGCATCAGCCGACGCAGTATCCGACCTCGGAAGAGCTGAGCATCGGAAAAATTAAGTTCAAGGCGTTCGATTTGGGAGGGCATCAGATCGCGCGTAGAGTTTGGAAGGATTATTACGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782200.1
MFLLDWFYGVLASLGLWQKEAKILFLGLDNAGKTTLLHMLKDERLVQHQPTQYPTSEELSIGKIKFKAFDLGGHQIARRVWKDYYAKVDAVVYLVDAYDKERFAESKKELDALLSDEALATVPFLILGNKIDIPYAASEEELRYHLGLTGVTTGKGKVNLADSNVRPLEVFMCSIVRKMGYGDGFKWVSQYIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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