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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000822`

染色体: Chr08 坐标: 6076485-6079359 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000822`
名称	SmilChr08G000822
描述	probable pectinesterase 53
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6076485 - 6079359 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000404`
GeneID	`131000404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000404`
原始查询	`SmilChr08G000822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase 53
产物	probable pectinesterase 53
Arabidopsis	`AT5G19730` (AT5G19730) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832093] identity=48.9; qcov=0.814; evalue=2.85e-108; confidence=high
Rice	`Os12g0563700` (OsPME35) - identity=50.9; qcov=0.859; evalue=1.08e-114; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057782274.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057782274.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782274.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782274.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6076960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B21,B59,B64,C27
`Chr8:6076967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A10,A3,A4,A5,A7,B11,B126,B23,B40,B53,B60,B7,B72,B74,B91,C22,C28,C45,C57,C73,C80,D1,D7,D9
`Chr8:6077452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:6078738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:6078768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B82
`Chr8:6078814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B118,B4
`Chr8:6079099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr8:6079315`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	106	A13,A16,A18,A2,A21,A23,A4,A6,A8,B10,B100,B103,B106,B108,B111,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B128,B129,B13,B130,B137,B139,B15,B16,B18,B19,B2,B23,B26,B27,B28,B31,B32,B35,B38,B39,B40,B42,B44,B46,B48,B5,B52,B59,B62,B63,B64,B66,B68,B70,B73,B75,B77,B8,B85,B93,B94,B98,C11,C14,C16,C17,C18,C20,C22,C25,C27,C3,C30,C32,C33,C37,C39,C43,C44,C47,C50,C54,C57,C59,C6,C61,C62,C68,C69,C70,C71,C72,C75,C80,C81,C82,C83,C85,C86,D10,D11,D4,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782274.1

382 aa

191

382

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 79-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782274.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	79	371	5.7e-73	246.0	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926291.1
TACCCATATTTGTTGTTCATGCAGCTGGCTGTCCTAGCTAATTTCCTACACACAAACATCATGCCTCTTAGTCTTAGATTCACCATTAATCTCTTCTTCCTCTTATGCCCAATCATAGTTCGCTCCGACGCCCACGCGGACTTGGACGCGTGGGTTTCGTGGCACGTCCGACGTCACAAGCAGCAGAAATCCGTAGCCGTTACCCAAGAACTGAACGACTTGAGGTGGAAGGCCGAGTCGAATAGAATGGAAGTGAGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000404
ATGCAGCTGGCTGTCCTAGCTAATTTCCTACACACAAACATCATGCCTCTTAGTCTTAGATTCACCATTAATCTCTTCTTCCTCTTATGCCCAATCATAGTTCGCTCCGACGCCCACGCGGACTTGGACGCGTGGGTTTCGTGGCACGTCCGACGTCACAAGCAGCAGAAATCCGTAGCCGTTACCCAAGAACTGAACGACTTGAGGTGGAAGGCCGAGTCGAATAGAATGGAAGTGAGCGTGAGCCAGGATGGGAGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782274.1
MQLAVLANFLHTNIMPLSLRFTINLFFLLCPIIVRSDAHADLDAWVSWHVRRHKQQKSVAVTQELNDLRWKAESNRMEVSVSQDGSADFITINDALNTIPLHNTRRVVIRINSGLYREKVNIPKTMSFVTLVGNASDPPTITGNDTASTVRGRDGTPLRTFQSATVAVDADYFTAINVKFENTAPHVVGTRGGQAAALRISGTKAAFYNCSFYGSQDTLYDHKGLHYFNNCFIQGSVDFIFGYGTSLYENCYLKSVTQKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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