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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000833`

染色体: Chr08 坐标: 6168109-6171817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000833`
名称	SmilChr08G000833
描述	U1 small nuclear ribonucleoprotein A
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6168109 - 6171817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000416`
GeneID	`131000416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000416`
原始查询	`SmilChr08G000833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U1 small nuclear ribonucleoprotein A
产物	U1 small nuclear ribonucleoprotein A
Arabidopsis	`AT2G47580` (U1A) spliceosomal protein U1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819371] identity=73.2; qcov=0.98; evalue=1.17e-124; confidence=high
Rice	`Os05g0154800` - identity=68.1; qcov=1; evalue=2.56e-116; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0030619 (U1 snRNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782284.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057782284.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057782284.1`
4	Chromatin	染色质	0.40000	`XP_057782284.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782284.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6168274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:6168280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A19,B1,B117
`Chr8:6168295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6168299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:6168312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A19,B117
`Chr8:6168500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6168560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6168580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D11
`Chr8:6168616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6170896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:6171326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782284.1

251 aa

126

251

RRM_5

RRM_1

RRM_5

RRM_1

PF13893 RRM_5 13-110 aa PF00076 RRM_1 25-95 aa PF13893 RRM_5 170-248 aa PF00076 RRM_1 179-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782284.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	13	110	2.5e-10	40.8	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057782284.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	25	95	6.4e-26	90.7	RNA recognition motif
`XP_057782284.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	170	248	2.5e-10	40.8	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057782284.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	179	239	6.4e-26	90.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926301.1
GAATTAAAGCCCAATAAATAGGCCCACGAACTAAAACCCCAATTCCATCTTTGAATCTCAGCTCGAAACTTCCATTTTCGAATCGATCGTTGCCGCCGTGAAATTCTCGATTACCGGAGAAGAAATAGCGAGCCAGTGTCCATGGAGGAGGCACCACCAGCCCCCGCGCCGGCCTCTGCTGCCGCCGGTCCGGAAACTGCTGCGAATCAGACGATTTACATTAATAATCTCAACGAGAAAATTAAGCTCGACGAATTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000416
ATGGAGGAGGCACCACCAGCCCCCGCGCCGGCCTCTGCTGCCGCCGGTCCGGAAACTGCTGCGAATCAGACGATTTACATTAATAATCTCAACGAGAAAATTAAGCTCGACGAATTGAAGAAATCGCTGCACGCTGTGTTTTCGCAGTTCGGGAAAATACTGGAGGTATTGGCGTTCAAAACCCTAAAGCATAAGGGGCAAGCATGGGTTGTTTTTGACGAGGTCTCTTCCGCCTCCAATGCGCTTCGTCAAATGCAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782284.1
MEEAPPAPAPASAAAGPETAANQTIYINNLNEKIKLDELKKSLHAVFSQFGKILEVLAFKTLKHKGQAWVVFDEVSSASNALRQMQGFPFYDKPMRIQYAKSKSDVIAKADGTFVPREKRKKHDDRGRKKKDQHDSNQAAAGLNSAYAGSYGSAPPLSQIPFMGARSAPEAPAPPNNILFIQNLPHQTTSMMLQMLFSQCPGFKEVRMIEAKPGIAFVEYENEMQSTVAMQGLQGFKITDDHPMLVTYAKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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