当前解析结果
SmilChr08G000960| 统一基因 ID | SmilChr08G000960 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000960 |
| 描述 | serine carboxypeptidase-like 47 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 7156054 - 7156876 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998002 |
|---|---|
| GeneID | 130998002 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130998002 |
| 原始查询 | SmilChr08G000960 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | serine carboxypeptidase-like 47 |
| 产物 | serine carboxypeptidase-like 47 |
| 拟南芥 | AT3G45010 (scpl48)serine carboxypeptidase-like 48 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823636] identity=58.14; qcov=0.982; evalue=1.54e-88; confidence=high |
| 水稻 | Os02g0114200 (CBP3)- identity=57.48; qcov=0.982; evalue=1.83e-85; confidence=high |
| GO | GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00450 (Peptidase_S10) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998002 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 胞外分泌 | 0.80000 | XP_057779424.1 |
| 2 | 液泡 | 0.80000 | XP_057779424.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:7156072 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,C31 |
Chr8:7156080 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,C31 |
Chr8:7156083 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,C31 |
Chr8:7156288 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 16 | A1,A23,B113,B123,B2,B22,B25,B46,C12,C44,C65,C74,C77,C8,C9,D3 |
Chr8:7156401 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A23 |
Chr8:7156401 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr8:7156546 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B13,B68 |
Chr8:7156831 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | A2,A9,B101,B114,B137,B24,B41,B56,B59,B7,B71,B78,B96,B99,C13,C61,C63,C67,C75,C85,D8 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779424.1PF00450
Peptidase_S10 16-214 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779424.1 |
Pfam | PF00450 |
Peptidase_S10 | Domain | 16 | 214 | 9.6e-41 | 141.2 | Serine carboxypeptidase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。