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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000975`

染色体: Chr08 坐标: 7272962-7274941 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000975`
名称	SmilChr08G000975
描述	high affinity nitrate transporter 2.6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7272962 - 7274941 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000567`
GeneID	`131000567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000567`
原始查询	`SmilChr08G000975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high affinity nitrate transporter 2.6-like
产物	high affinity nitrate transporter 2.6-like
Arabidopsis	`AT5G60770` (NRT2.4) nitrate transporter 2.4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836198] identity=71.8; qcov=0.98; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os02g0112600` (NRT2.1) - identity=67.47; qcov=0.978; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0015706 (nitrate transmembrane transport); GO:0071249 (cellular response to nitrate)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000567

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057782546.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057782546.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057782546.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057782546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7273297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:7273371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:7273449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:7273471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:7273476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B32
`Chr8:7273789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr8:7274048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:7274090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:7274693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A18,C50,C78,D3
`Chr8:7274768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:7274795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B16,B77,C19,C52
`Chr8:7274868`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A5,B100,B117,B127,B19,B34,B48,B56,B80,B95,B96,C16,C22,C34,C4,C40,C42,C47,C49,C50,C54,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782546.1

509 aa

254

509

MFS_1

PF07690 MFS_1 46-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782546.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	46	402	3.2e-23	82.9	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926563.1
CATTTGAGAGCACACCAAACTTAATATCTCTTCTCTTTTGAAATGGCCGATATGAATGCGCCTCCCTTCTCCGCCACGGTTACTAAATTCTCTTTGCCGGTAGATTCGGAGCACAAGGCGAAAGTCCTGAAAATCGGGTCGTTCGCGCAGCCCCACATGCGATCCTTCCACTTGGCCTGGATCTCCTTCTTCACGTGCTTCGTCTCCACCTTCGCGGCGGCGCCCTTGGTCCCCATCATCCGGGACAACATCAACCTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000567
ATGGCCGATATGAATGCGCCTCCCTTCTCCGCCACGGTTACTAAATTCTCTTTGCCGGTAGATTCGGAGCACAAGGCGAAAGTCCTGAAAATCGGGTCGTTCGCGCAGCCCCACATGCGATCCTTCCACTTGGCCTGGATCTCCTTCTTCACGTGCTTCGTCTCCACCTTCGCGGCGGCGCCCTTGGTCCCCATCATCCGGGACAACATCAACCTGAGCCGCTCCGACATCGGCAATGCCGGCGTCGCCTCCGTCTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782546.1
MADMNAPPFSATVTKFSLPVDSEHKAKVLKIGSFAQPHMRSFHLAWISFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNINLSRSDIGNAGVASVSGSIFSRLMMGVVCDLIGPRYGCAVLNLLAAPVVFSTVFVSSPQGYVAVRFMTGFSLATFVSCQYWTSVMFNSSIIGTVNGVAGGWGDMGGGVTQLLMPFLFHLIKLSGATPFTAWRIAFIIPGWLHVIIGVMVLTMGQDLPDGNLSTLQKSGDVAKDKFSKVFAHAVTNYRTWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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