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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000980`

染色体: Chr08 坐标: 7349676-7352596 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000980`
名称	SmilChr08G000980
描述	ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7349676 - 7352596 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000556`
GeneID	`131000556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000556`
原始查询	`SmilChr08G000980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like
产物	ruBisCO large subunit-binding protein subunit alpha-like
Arabidopsis	`AT2G28000` (CPN60A) chaperonin-60alpha [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817344] identity=86; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0277500` (OsCPn60alpha1) - identity=81.9; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0042026 (protein refolding); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782527.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057782527.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057782527.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782527.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7349970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C74
`Chr8:7350038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:7350131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B79,B81,B87
`Chr8:7350176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A4,B99,C87
`Chr8:7350442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C18,C19
`Chr8:7350505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:7350649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B8,C27,C84
`Chr8:7350656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B112,C78,D3
`Chr8:7350937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:7351033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:7351042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B136,B68,C19,D11
`Chr8:7351295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B91,C24,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782527.1

592 aa

296

592

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 67-570 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782527.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	67	570	2.9e-77	261.1	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926544.1
GAAGCAAAAGATGAATCTTCTAGAACAACCACCCCACTCTCTACTTAGCCTCATTGCGCGTTGCCTTATCCACACCTCAACTCCTGCAATTCTTCGGTTCTCGCAAAAATGGCTTCAGCCAACGCCATCTCTTCAGCTTCAATTCTTCCTTCTCCTTCTAAAGACTGGCGATTGAAGAACAGTAGAGCGAGTCAATTGCGGCAGGGGCAGAAGCAGGGTAAAAACCGGTTTATGGTGAGGGCTAATGCTAAGGATATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000556
ATGGCTTCAGCCAACGCCATCTCTTCAGCTTCAATTCTTCCTTCTCCTTCTAAAGACTGGCGATTGAAGAACAGTAGAGCGAGTCAATTGCGGCAGGGGCAGAAGCAGGGTAAAAACCGGTTTATGGTGAGGGCTAATGCTAAGGATATTGCCTTCGACCAGAAATCCAGGTCTGCCATGCAGGCCGGTATCGATAAGCTCGCCGATGCTGTCGGTCTCACCCTCGGCCCCAGAGGGCGGAATGTTGTTTTAGATGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782527.1
MASANAISSASILPSPSKDWRLKNSRASQLRQGQKQGKNRFMVRANAKDIAFDQKSRSAMQAGIDKLADAVGLTLGPRGRNVVLDEFGSVKVVNDGVTIARAIELPDPMENAGAALIREVASKTNDSAGDGTTTASILAREIIKLGLLSVTSGANPVSLKRGIDKTVQGLVVELEKRARPIKGREDILAVAAISAGNDESIGTMIADAVDKVGPDGVLSIESSSSFETTVDVEEGMEIDRGYISPQFVTNPEKLLVEFEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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