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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001124`

染色体: Chr08 坐标: 8741409-8744480 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001124`
名称	SmilChr08G001124
描述	mitogen-activated protein kinase 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8741409 - 8744480 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000706`
GeneID	`131000706`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000706`
原始查询	`SmilChr08G001124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase 3
产物	mitogen-activated protein kinase 3
Arabidopsis	`AT3G45640` (MPK3) mitogen-activated protein kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823706] identity=80.8; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0154500` (MAPK6) - identity=77.9; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004707 (MAP kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF06293 (Kdo); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000706

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782724.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782724.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782724.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782724.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8742904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B46,B53,C9
`Chr8:8742914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B46,B53,C9
`Chr8:8742942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:8743022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B46,B5,B53,C9
`Chr8:8743691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:8743958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:8744004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:8744006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782724.1

373 aa

186

373

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kdo

PF00069 Pkinase 46-327 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 47-237 aa PF06293 Kdo 77-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782724.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	46	327	9.4e-72	242.3	Protein kinase domain
`XP_057782724.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	47	237	4.4e-32	112.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057782724.1`	Pfam	`PF06293`	Kdo	Family	77	183	8.1e-05	22.9	Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926741.1
CTTGTAGCTACTACTACTCCAACTTCTGAAAAACGTGCAAACTCACTTTTTAACCAGTTTTACATATTAAATTCCCTCACATTTATAATTAGACATCAATTAAATTCCAAAAATGAGAGGCAATAATAATAATAAAGAGTTCCGCGCAATAATGGAGAGGAATCGTTGACAAAACGGCAGAGCAAATGTGGAGCATTGGATCTGAAAGCAAGACCAAGTGAGGGCCGTCCGATGGGGGGCGGCTCAAGTTTGGGTTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000706
ATGGCTGACATGGGAGCTGCCGGCGGCCAGTACCCCGATTTTCCGGCGGTGGCCACGCACGGCGGCCAGTTTATCCAGTACAATATCTTCGGCAACACCTTCGAGGTCACCACCAAGTACCGCCCCCCGATCATGCCTATTGGCCGCGGAGCTTACGGCATAGTCTGCTCGGTGATGAACTCGGAGAGCAACGAGATGGTGGCGGTGAAGAAGATTGCCAATGCCTTCGACAACTACATGGATGCCAAGAGGACTCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782724.1
MADMGAAGGQYPDFPAVATHGGQFIQYNIFGNTFEVTTKYRPPIMPIGRGAYGIVCSVMNSESNEMVAVKKIANAFDNYMDAKRTLREIKLLRHLDHENVIAITDVIPPPLRREFTDVYIATELMDTDLHQIIRSNQGLSEEHCQYFLYQLLRGLKYIHSAGVIHRDLKPSNLLLNANCDLKICDFGLARTSSENDFMTEYVVTRWYRAPELLLNSSEYTAAIDVWSVGCIFMELMNRKPLFAGKDHVHQMHLLIELLGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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