当前解析结果
SmilChr08G001125| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001125 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001125 |
| 描述 | L-ascorbate peroxidase, cytosolic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 8751326 - 8754294 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000707 |
|---|---|
| GeneID | 131000707 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000707 |
| 原始查询 | SmilChr08G001125 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | L-ascorbate peroxidase, cytosolic-like |
| 产物 | L-ascorbate peroxidase%2C cytosolic-like |
| Arabidopsis | AT1G07890 (APX1)ascorbate peroxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837304] identity=79.2; qcov=1; evalue=7.98e-151; confidence=high |
| Rice | Os07g0694700 (APX2)- identity=79; qcov=0.988; evalue=6.63e-148; confidence=high |
| GO | GO:0000302 (response to reactive oxygen species); GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0020037 (heme binding); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process) |
| KEGG | smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00141 (peroxidase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000707 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057782725.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057782725.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057782725.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782725.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782725.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:8752857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B11,B18 |
Chr8:8752981 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B14 |
Chr8:8752981 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr8:8753946 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782725.1PF00141
peroxidase 27-227 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782725.1 |
Pfam | PF00141 |
peroxidase | Domain | 27 | 227 | 5e-47 | 161.4 | Peroxidase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。