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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001348`

染色体: Chr08 坐标: 10785339-10795018 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001348`
名称	SmilChr08G001348
描述	uncharacterized SmilChr08G001348
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10785339 - 10795018 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000822`
GeneID	`131000822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000822`
原始查询	`SmilChr08G001348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phox domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816086]; symbol=AT2G15900; hit=AT2G15900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	phox domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816086]; symbol=AT2G15900; hit=AT2G15900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G15900` (AT2G15900) phox domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816086] identity=51.42; qcov=0.991; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os11g0159000` - identity=58.4; qcov=0.262; evalue=4.13e-101; confidence=weak
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding)
KEGG	-
Pfam	PF00787 (PX); PF02194 (PXA); PF08628 (Nexin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000822

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057782898.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057782898.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057782898.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057782898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10786408`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr8:10786408`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr8:10786603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B54,C2
`Chr8:10786660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:10786682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B65,B93
`Chr8:10787172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:10787258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr8:10788335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B138,B15,C1
`Chr8:10788465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B99,C39
`Chr8:10788524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B17,B73,C3,C40
`Chr8:10788677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:10788754`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A10,A6,B108,B109,B112,B122,B129,B13,B133,B19,B25,B49,B52,C1,C12,C32,C68,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782898.1

956 aa

478

956

PXA

Nexin_C

PF02194 PXA 107-285 aa PF00787 PX 551-628 aa PF08628 Nexin_C 779-915 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782898.1`	Pfam	`PF02194`	PXA	Family	107	285	3.2e-40	139.0	PXA domain
`XP_057782898.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	551	628	6.2e-14	53.0	PX domain
`XP_057782898.1`	Pfam	`PF08628`	Nexin_C	Family	779	915	9.7e-26	91.0	Sorting nexin C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926915.1
TTTCCCTCGTATGACCTTTCTCTTAATTTCTTCCTCACAAATAGCACGAAAATGGAGTTGTTTCTATTGAAAGGAAAAGAAAGGAGAGGAAATGACTGAAATACTATCTCAGAAACGATCAGGAAAAATCTGATCCTTTTCTCCTCTGGATTATCTTTAGTTATAAGTGCGCCGGATTTGTTGATTTTATGTTTACATTCTCATCGCCGGATTAATTTTGATGTTCAAACGGTGCTATTATATTTCTCGATCCTACGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782898.1_41982
ATGAAGACGCTGGCGGATGGGATACAAGATCTAATCCGGGAAGCCAAGCTTCGGACGGTGTGGTGGATGCTGTGTATTTTCGCTGTGACTTATTGCTTGACGCATACTAGTAAATCCATGCTAATGAATATTCCAATAGCTGTACTCTTGGTTGCTGGGCTGAGGATACTATTTAATGAGGTGGACTTCCAGTGGAAGATTCGGAATACCCGAGCAACATCTTACTTGTCACACTTAGAAAAGAAGCAGCTGTCCGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782898.1
MKTLADGIQDLIREAKLRTVWWMLCIFAVTYCLTHTSKSMLMNIPIAVLLVAGLRILFNEVDFQWKIRNTRATSYLSHLEKKQLSVNDSRLSTKPPSPQEWKRKIDSPIVEAAIEDFVNKALHEFVIDLWYSEITPDKEGPELIRAIIMEVLGDVSGRLKEVNLVELLTRDIVDLIGDHIDLFRRNQTAIGRDVMGTLSSEERDEKLKQHLMASKELHPALISPECEYKVIQQLMGGLLAVVLRPTEARCPIIRCIAREL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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