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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G001658

染色体: Chr08 坐标: 13785322-13792747 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G001658
名称SmilChr08G001658
描述uncharacterized SmilChr08G001658
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向13785322 - 13792747 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131001203
GeneID131001203
locus_tag-
NCBI 名称LOC131001203
原始查询SmilChr08G001658

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述Sas10/Utp3/C1D family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837299]; symbol=AT1G07840; hit=AT1G07840; species=arabidopsis; confidence=high
产物Sas10/Utp3/C1D family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837299]; symbol=AT1G07840; hit=AT1G07840; species=arabidopsis; confidence=high
拟南芥AT1G07840 (AT1G07840)
Sas10/Utp3/C1D family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837299]
identity=56.35; qcov=0.959; evalue=5.63e-112; confidence=high
水稻Os01g0911000
-
identity=52.12; qcov=0.95; evalue=4.44e-96; confidence=high
GOGO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG-
PfamPF04000 (Sas10_Utp3)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131001203

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 细胞核 1.00000 SmilChr08G001658.1
2 核仁 1.00000 SmilChr08G001658.1
3 核仁纤维中心 0.40000 SmilChr08G001658.1
4 核质 0.40000 SmilChr08G001658.1
5 染色体 0.20000 SmilChr08G001658.3

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:13790475 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C11,C69
Chr8:13791350 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B104
Chr8:13791376 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B137
Chr8:13791388 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B125,C21,C36
Chr8:13791409 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B125,C21,C36
Chr8:13791617 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10
Chr8:13791648 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C85,D4
Chr8:13791957 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B38,B39
Chr8:13792140 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G001658.1
来源蛋白: XP_057783501.1
353 aa
N
1
176
353
Sas10_Utp3
C
PF04000 Sas10_Utp3 25-105 aa
SmilChr08G001658.2
来源蛋白: XP_057783502.1
353 aa
N
1
176
353
Sas10_Utp3
C
PF04000 Sas10_Utp3 25-105 aa
SmilChr08G001658.3
来源蛋白: XP_057783503.1
317 aa
N
1
158
317
Sas10_Utp3
C
PF04000 Sas10_Utp3 25-105 aa
SmilChr08G001658.4
来源蛋白: XP_057783504.1
317 aa
N
1
158
317
Sas10_Utp3
C
PF04000 Sas10_Utp3 25-105 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr08G001658.1
XP_057783501.1		 Pfam PF04000 Sas10_Utp3 Family 25 105 2e-20 73.8 Sas10/Utp3/C1D family
SmilChr08G001658.2
XP_057783502.1		 Pfam PF04000 Sas10_Utp3 Family 25 105 2e-20 73.8 Sas10/Utp3/C1D family
SmilChr08G001658.3
XP_057783503.1		 Pfam PF04000 Sas10_Utp3 Family 25 105 1.7e-20 74.1 Sas10/Utp3/C1D family
SmilChr08G001658.4
XP_057783504.1		 Pfam PF04000 Sas10_Utp3 Family 25 105 1.7e-20 74.1 Sas10/Utp3/C1D family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057927521.1
TAACTAAATGTAAAATAGTAGTAAAACAAATATAAACAAAATAAAATGCCCTAATTTTATTTCATTACGTCGCGCCGCTTCTTCTTCATCGATCCATCGCAGCTTCTTCTTCAATTCATCGCCGGTGCTTCTGCCGGGCCGGCCCTAGCCTTCACTCTGCTTCATCTTCTTCCGCTTCCTTCTTCTTCTTCACTCTGCTTCGTGTTTTTGCGTATCGGTTGGATAGTTTGTGCAATCATAGACATTGATAGTTTTTGAAA...
XM_057927519.1
TCAATTCATCGCCGGTACTCTGCTTCATCTTCTTCCGCTTCCTTCTTCTTCTTCACTCTGCTTCGTGTTTTTGCGTATCGGTTGGATAGTTTGTGCAATCATAGACATTGATAGTTTTTGAAATCACTTGACCAGCAGAAAGAATGACAGAGGCACTTAGTTCTACGCCCAGCGATGAACGAATTAGTAGAGAATCTCCACAGCTGGTTGCTCTGTTGAAGGAAATGAAGGAAGGTTTGGATAATGTGAGGAGTAAAATC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
SmilChr08G001658.3 (XP_057783503.1)
ATGACAGAGGCACTTAGTTCTACGCCCAGCGATGAACGAATTAGTAGAGAATCTCCACAGCTGGTTGCTCTGTTGAAGGAAATGAAGGAAGGTTTGGATAATGTGAGGAGTAAAATCGAATCTTTGACTTCCAAGGTGAAAGCAGGAAATTTCCCAACATCAGATGGTATAAGCTATCTCGAGGCCAAGCACTTGCTTCTTCTGAACTATTGTCAGTCTCTCGTTTATTTTCTGCTTCGCAAGGCGAAAGGATTATCAAT...
SmilChr08G001658.4 (XP_057783504.1)
ATGACAGAGGCACTTAGTTCTACGCCCAGCGATGAACGAATTAGTAGAGAATCTCCACAGCTGGTTGCTCTGTTGAAGGAAATGAAGGAAGGTTTGGATAATGTGAGGAGTAAAATCGAATCTTTGACTTCCAAGGTGAAAGCAGGAAATTTCCCAACATCAGATGGTATAAGCTATCTCGAGGCCAAGCACTTGCTTCTTCTGAACTATTGTCAGTCTCTCGTTTATTTTCTGCTTCGCAAGGCGAAAGGATTATCAAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
SmilChr08G001658.1 (XP_057783501.1)
MTEALSSTPSDERISRESPQLVALLKEMKEGLDNVRSKIESLTSKVKAGNFPTSDGISYLEAKHLLLLNYCQSLVYFLLRKAKGLSIQGHPVVRSLVEIRLFLEKIRPVDRKMQYQIQKLTNTTTTMAEPGSTEKGTDKQEKAEDLLKYRPNPDLLISKTKATSEDGSGVYRPPKFAPVEDKMSKQEKNILRKEVQMMRQAKQSAYVRELMDDLQGKPEEIRESVGVESREAMKYMAKMEERAQQEEELFTRAPITKAEK...
SmilChr08G001658.2 (XP_057783502.1)
MTEALSSTPSDERISRESPQLVALLKEMKEGLDNVRSKIESLTSKVKAGNFPTSDGISYLEAKHLLLLNYCQSLVYFLLRKAKGLSIQGHPVVRSLVEIRLFLEKIRPVDRKMQYQIQKLTNTTTTMAEPGSTEKGTDKQEKAEDLLKYRPNPDLLISKTKATSEDGSGVYRPPKFAPVEDKMSKQEKNILRKEVQMMRQAKQSAYVRELMDDLQGKPEEIRESVGVESREAMKYMAKMEERAQQEEELFTRAPITKAEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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