当前解析结果
SmilChr08G001726| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001726 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001726 |
| 描述 | inosine triphosphate pyrophosphatase |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 14497613 - 14501871 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001272 |
|---|---|
| GeneID | 131001272 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001272 |
| 原始查询 | SmilChr08G001726 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | inosine triphosphate pyrophosphatase |
| 产物 | inosine triphosphate pyrophosphatase |
| Arabidopsis | AT4G13720 (AT4G13720)Inosine triphosphate pyrophosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827006] identity=82.9; qcov=0.946; evalue=6.02e-121; confidence=high |
| Rice | Os10g0457500- identity=79.6; qcov=0.912; evalue=3.32e-112; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009143 (nucleoside triphosphate catabolic process); GO:0047429 (nucleoside triphosphate diphosphatase activity) |
| KEGG | smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01725 (Ham1p_like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001272 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057783597.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057783597.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057783597.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057783597.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783597.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:14497807 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr8:14497861 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B99,C12,C82 |
Chr8:14497984 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A7,B135,B40,C33 |
Chr8:14498009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B29 |
Chr8:14499376 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B105,B134 |
Chr8:14499376 |
TTC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B105,B134 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783597.1PF01725
Ham1p_like 17-191 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783597.1 |
Pfam | PF01725 |
Ham1p_like | Domain | 17 | 191 | 1.3e-55 | 188.9 | Ham1 family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。