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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001858`

染色体: Chr08 坐标: 15961523-15963989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001858`
名称	SmilChr08G001858
描述	inositol-3-phosphate synthase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15961523 - 15963989 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001400`
GeneID	`131001400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001400`
原始查询	`SmilChr08G001858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inositol-3-phosphate synthase
产物	inositol-3-phosphate synthase
Arabidopsis	`AT5G10170` (MIPS3) myo-inositol-1-phosphate synthase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830881] identity=89.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0192700` (OsINO1) - identity=85.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004512 (inositol-3-phosphate synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006021 (inositol biosynthetic process); GO:0008654 (phospholipid biosynthetic process)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01658 (Inos-1-P_synth); PF07994 (NAD_binding_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783765.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783765.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783765.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783765.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15961775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr8:15962457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C71
`Chr8:15962673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C9
`Chr8:15962806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:15962826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr8:15963267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B131
`Chr8:15963474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:15963748`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B105,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783765.1

510 aa

255

510

NAD_binding_5

Inos-1-P_synth

PF07994 NAD_binding_5 62-494 aa PF01658 Inos-1-P_synth 310-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783765.1`	Pfam	`PF07994`	NAD_binding_5	Family	62	494	7.4e-141	470.0	Myo-inositol-1-phosphate synthase
`XP_057783765.1`	Pfam	`PF01658`	Inos-1-P_synth	Family	310	423	3.2e-37	127.7	Myo-inositol-1-phosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927782.1
ACTCACACACACAGCACAATACAGAGGCACACACTTGTTTTCCGCTCCTAAAATCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCAACAAACAAATTCTCCTTTTCCGAAAATGTTTATCGAGAGCTTCAAGGTCGAAAGCCCCAACGTGAAGTACACAGACACTGAGATTCACTCTGTCTACAACTACGAAACCACCGAGCTCGTTCACGAGAACAGAAACGGCTCTTACCACTGGATTGTGAAGCCCAAAACTGTCCAATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001400
ATGTTTATCGAGAGCTTCAAGGTCGAAAGCCCCAACGTGAAGTACACAGACACTGAGATTCACTCTGTCTACAACTACGAAACCACCGAGCTCGTTCACGAGAACAGAAACGGCTCTTACCACTGGATTGTGAAGCCCAAAACTGTCCAATACGAGTTCAAAACCGACGCCCATGTCCCTAAATTAGGGGTTATGCTTGTTGGGTGGGGAGGGAACAACGGCTCAACCCTTACTGCTGGCGTCATTGCAAATCGGGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783765.1
MFIESFKVESPNVKYTDTEIHSVYNYETTELVHENRNGSYHWIVKPKTVQYEFKTDAHVPKLGVMLVGWGGNNGSTLTAGVIANREGISWATKDKVQQANYFGSLTQASSIRVGSFNGEEIYAPFKSLLPMVNPDDIVFGGWDISDMNLGDAMGRAKVLDIDLQKQLRPYMEHMVPLPGIYDADFIAANQGARANNVIKGTKKEQVEQVMRDIREFKEKKKVERVVVLWTGNTERYSNVVVGLNDTSENLMASLERNESE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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