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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002011`

染色体: Chr08 坐标: 17870969-17874254 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002011`
名称	SmilChr08G002011
描述	THO complex subunit 4D-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17870969 - 17874254 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001651`
GeneID	`131001651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001651`
原始查询	`SmilChr08G002011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	THO complex subunit 4D-like
产物	THO complex subunit 4D-like
Arabidopsis	`AT5G37720` (ALY4) ALWAYS EARLY 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833750] identity=56.4; qcov=0.914; evalue=2.06e-66; confidence=high
Rice	`Os08g0427900` - identity=50.9; qcov=0.883; evalue=4.41e-61; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006406 (mRNA export from nucleus)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13865 (FoP_duplication)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784191.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057784191.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057784192.1`
4	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057784191.1`
5	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057784191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17872401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C77
`Chr8:17872785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:17873460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784191.1

277 aa

138

277

RRM_1

FoP_duplication

PF00076 RRM_1 100-168 aa PF13865 FoP_duplication 216-272 aa

XP_057784192.1

256 aa

128

256

RRM_1

FoP_duplication

PF00076 RRM_1 79-147 aa PF13865 FoP_duplication 195-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784191.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	100	168	3.1e-12	46.9	RNA recognition motif
`XP_057784191.1`	Pfam	`PF13865`	FoP_duplication	Family	216	272	2.7e-07	31.8	C-terminal duplication domain of Friend of PRMT1
`XP_057784192.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	79	147	2.7e-12	47.1	RNA recognition motif
`XP_057784192.1`	Pfam	`PF13865`	FoP_duplication	Family	195	251	4e-07	31.3	C-terminal duplication domain of Friend of PRMT1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928208.1
ATGCCCAATAAGGCCCATAAATTGCTTATAAAGTTATAGTCGAAGAAATGTTTTTATTCCATCATTTTCTTTTCGTCTGAAACCCTAGCTCCTCTTGAAAAACTACCCCCGTTTCGCACTCGATTCATCTGCAAATTGTTTCACAAATTCTTAACTCACCCTCAGATCTCTCTCTCTCCTCCCAAGTCTCCTCTCTCTTTATCGGTTTGTGTTCAAGTGCTTGTACGTTTATTGCTTAGGATCTTCTGATACCAAAGGAT...

XM_057928209.1
GTTTTTATTCCATCATTTTCTTTTCGTCTGAAACCCTAGCTCCTCTTGAAAAACTACCCCCGTTTCGCACTCGATTCATCTGCAAATTGTTTCACAAATTCTTAACTCACCCTCAGATCTCTCTCTCTCCTCCCAAGTCTCCTCTCTCTTTATCGGTTTGTGTTCAAGTGCTTGTACGTTTATTGCTTAGGATCTTCTGATACCAAAGGATCGAAGGATTTCTTTGCTATTCCTGCCTTCTACGCGCTGATTTTAGCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001651
ATGGCCTCTCTGGATATGTCTTTGGATGATATGATAAAGAGTAGAAGAAATACTGTTAAAGGAGGCAGAGGGCAAGGCAGGCCACGACGTGGAAGAGGAGGGCCTGGAGGGTCATCCCGTGGTGGAAGACCACCATTTGGCGCTCCTCGCAGAAATCCTCTTGGAGTGAACACTCGAACTTCAGCCTACTCTATTGCCAAGTCGTTCCGCAGAACCAAGAACTTACCATGGCAGAGTGGTCTGATTGAAGAAAGTCTTAA...

LOC131001651
ATGGATGTCATTACCATACTGTGGAATACTCTGGGGCGAGATATTTGTCGTATCTCAGTTCATGGAATCTTGCAAAGGTGGCTTCCTTCGCTGAACTTGAGAACTGGAGCTCTCACCTTTGTATGGCACTGGCATGGTTCGTTCCGCAGAACCAAGAACTTACCATGGCAGAGTGGTCTGATTGAAGAAAGTCTTAAGGCAGCTGGGCTGTCAGGGTTGGAAGCTGGTACAAAGTTATTTATTTCAAACTTGGACGTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784191.1
MASLDMSLDDMIKSRRNTVKGGRGQGRPRRGRGGPGGSSRGGRPPFGAPRRNPLGVNTRTSAYSIAKSFRRTKNLPWQSGLIEESLKAAGLSGLEAGTKLFISNLDVGVSNEDIRELFSEIGELIRYAIHFDKNGRPSGSAEVVFARRSDAFQALKRYNNVQLDGKPMKIEVVGANAEIPLSARVNVVGGANGKKRTVVMSSGPGRSRGGFAPANRGSGQRGRGGSNTGRGGAGRGGARGHGGGRGRGGAQWRKKVEKSA...

XP_057784192.1
MDVITILWNTLGRDICRISVHGILQRWLPSLNLRTGALTFVWHWHGSFRRTKNLPWQSGLIEESLKAAGLSGLEAGTKLFISNLDVGVSNEDIRELFSEIGELIRYAIHFDKNGRPSGSAEVVFARRSDAFQALKRYNNVQLDGKPMKIEVVGANAEIPLSARVNVVGGANGKKRTVVMSSGPGRSRGGFAPANRGSGQRGRGGSNTGRGGAGRGGARGHGGGRGRGGAQWRKKVEKSADDLDKELDSYHAEAMQT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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