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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002015`

染色体: Chr08 坐标: 17892575-17894682 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002015`
名称	SmilChr08G002015
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17892575 - 17894682 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001583`
GeneID	`131001583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001583`
原始查询	`SmilChr08G002015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 3-like
Arabidopsis	`AT2G01630` (AT2G01630) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814692] identity=57.1; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0221500` (OJ1743A09.5) - identity=56.6; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057784051.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057784051.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784051.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784051.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17892709`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	B136,B139,B140,B25,B26,B41,B45,B62,B77,B86,B91,B94,C25,C39,C63,C65,C67,C7,C72
`Chr8:17893031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:17893177`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B119,B64,C47
`Chr8:17893177`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B119,B64,C47
`Chr8:17893474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:17893607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B122
`Chr8:17893762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:17893939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B122
`Chr8:17894109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C84
`Chr8:17894113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr8:17894119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784051.1

478 aa

239

478

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 23-327 aa PF07983 X8 338-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784051.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	23	327	8.4e-72	243.1	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057784051.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	338	409	1.2e-19	71.4	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928068.1
TTAAATTTTCTTGCTTTTCTACATTTGGTTAAGAGGGCTTCCAAGTTAGAAGAACAAGCAAGCATGGAAATATTAGTGCTGTTTCTTTTGGTTTCCACGCTCACAGCCTCAGCTGCTCAAGAGGCGTTCGTGGGCGTCAACATCGGAACAAAAGTGTCATCGAGCGAGGCGGCAGCCCTCCTCAAATCCCACGAAATCAAGCACGTCCGCCTCTACGACGCCGACGCCGACATGCTCCTCGCACTCGCAAATACAAGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001583
ATGGAAATATTAGTGCTGTTTCTTTTGGTTTCCACGCTCACAGCCTCAGCTGCTCAAGAGGCGTTCGTGGGCGTCAACATCGGAACAAAAGTGTCATCGAGCGAGGCGGCAGCCCTCCTCAAATCCCACGAAATCAAGCACGTCCGCCTCTACGACGCCGACGCCGACATGCTCCTCGCACTCGCAAATACAAGCATAACAGTTGCAGTCTCTGTGCCTAACGACCAAATCCTAGGCATATCCCTATCCAACTCCACTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784051.1
MEILVLFLLVSTLTASAAQEAFVGVNIGTKVSSSEAAALLKSHEIKHVRLYDADADMLLALANTSITVAVSVPNDQILGISLSNSTAAKWVSQNVVTHYPHTNITTICIGVDAPALLPNALKHMYTALSAANLEKQIKISAPLPYTIIQNSVPPSQAYFNKSLDPMLVPLLKFLQSTNSHFMITIYPYLEHVRSSDLFPLDYALFEPSKQTVDANTSLRYSNAFDAMVDAAYSAMAKLNITNVPIVVAETGWPSQGGTDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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