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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002069`

染色体: Chr08 坐标: 18558759-18560181 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002069`
名称	SmilChr08G002069
描述	GDP-mannose 4,6 dehydratase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18558759 - 18560181 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001631`
GeneID	`131001631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001631`
原始查询	`SmilChr08G002069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDP-mannose 4,6 dehydratase 1
产物	GDP-mannose 4%2C6 dehydratase 1
Arabidopsis	`AT5G66280` (GMD1) GDP-D-mannose 4,6-dehydratase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836760] identity=88.7; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0137700` (P0548D03.38-1) - identity=83.4; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008446 (GDP-mannose 4,6-dehydratase activity); GO:0019673 (GDP-mannose metabolic process)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01370 (Epimerase); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784158.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784158.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784158.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784158.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18559149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr8:18559403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C35
`Chr8:18559613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:18559802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B78,C82
`Chr8:18560018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784158.1

356 aa

178

356

Epimerase

GDP_Man_Dehyd

PF01370 Epimerase 13-263 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 14-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784158.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	13	263	1.2e-72	244.9	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057784158.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	14	330	1.7e-140	468.9	GDP-mannose 4,6 dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928175.1
AAATATAATAGGGAACATATATATTAGGCTCTACCCCATTCATTTATGAGTGAAATTAGAAAATAAATCCACAATTAATAAGAAGAAGAAGGAGAAAAAAGAAAAGTAAAAAAGGAAGTAGAGTTAGCAGAGAAGAGAAAAAAAAAAATCGTCAATAAATTTGAGTCTCGTTTCCATCGGCGTCTTCTTGTCCCCAAATTAGTTCCAATGGCCGTCAGATCTGAATCGGAATCGGCGAAAATCGCACTAATCACGGGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001631
ATGGCCGTCAGATCTGAATCGGAATCGGCGAAAATCGCACTAATCACGGGCATTACTGGGCAGGACGGTTCGTACCTGACGGAATTCCTCCTGGAGAAGGGGTACGAGGTGCACGGGCTGATCCGGCGGTCGTCTAACTTCAACACGCAGCGGATCAACCACATCTACATCGACCCTCACAACGCCCACAAGGCCCGCATGAAGCTCCACTACGCCGACCTCACCGACGCCTCCTCCCTCCGCCGCTGGCTCGACACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784158.1
MAVRSESESAKIALITGITGQDGSYLTEFLLEKGYEVHGLIRRSSNFNTQRINHIYIDPHNAHKARMKLHYADLTDASSLRRWLDTILPDEVYNLAAQSHVAVSFEIPDYTADVVATGALRLLEAVRSHIASSGRSHIRYYQAGSSEMFGSTPPPQSESTPFHPRSPYAAAKCAAHWYTVNYREAYGIFACNGILFNHESPRRGENFVTRKITRAVGRIKIGLQSKLFLGNLQASRDWGFAGDYVEAMWLMLQQDKPDDY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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