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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002084`

染色体: Chr08 坐标: 18726245-18729021 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002084`
名称	SmilChr08G002084
描述	ferredoxin--NADP reductase, leaf isozyme, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18726245 - 18729021 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001626`
GeneID	`131001626`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001626`
原始查询	`SmilChr08G002084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferredoxin--NADP reductase, leaf isozyme, chloroplastic
产物	ferredoxin--NADP reductase%2C leaf isozyme%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G20020` (FNR2) ferredoxin-NADP[+]-oxidoreductase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838591] identity=76.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0107700` (OsLFNR2) ferredoxin--NADP reductase, leaf isozyme 1, chloroplastic-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4339874] identity=86.5; qcov=0.883; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00175 (NAD_binding_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001626

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784148.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057784148.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784148.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784148.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18727383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C76,D8
`Chr8:18727737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A7,B135,B40,C33
`Chr8:18727984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:18728559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B28,B79,B83,C13
`Chr8:18728761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr8:18728791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784148.1

360 aa

180

360

NAD_binding_1

PF00175 NAD_binding_1 213-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784148.1`	Pfam	`PF00175`	NAD_binding_1	Domain	213	327	9.3e-28	97.8	Oxidoreductase NAD-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928165.1
TAGACAAGGAATCTTTATTCTTTAATTAGATATGGTGGTGAATCAAAATATCAAATTTGTGATGATTCTGTCAAAAAATATGAGTCATACACTTTCTCGCATTTTCTTATCCTAACTAGTGCCACTGCATTGTCTATTCCAATCTCCTCCACCAATCCTTAATCTTCTCTTTTCCTTCTCTCACTATACTTACTATCATCACTTCAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTTATTGATATCTTAGTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001626
ATGGCTGCTGCTGTAAGTGCTGCAGTCTCTCTTCCTACTTCCAAGTCTACTTCTCTTCCATCTAGAACCTCCATTATTTCTCCAGAAAGGATCAATTTTAACAAGTCATCGTTGCATTACCGTCATGTGTCGTCAGCGGTTGCTCCAATTCGAGCTCAAGTGAGCACAGAGGCACCTGCCAAGAAGGAGAAGCATTCCAAGAAACAGGAAGAGGGGGTAGTTGTCAACAAATTCAGGCCTAAAGAGCCATACATTGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784148.1
MAAAVSAAVSLPTSKSTSLPSRTSIISPERINFNKSSLHYRHVSSAVAPIRAQVSTEAPAKKEKHSKKQEEGVVVNKFRPKEPYIGKCLLNTKITGDEAPGETWHMLFSTEGEVPYREGQSIGIIPDGIDKNGKPHKLRLYSIASSALGDLGDSKTVSLCVKRLVYTNDQGEIVKGVCSNFLCDLTPGAEVKITGPVGKEMLLPKDPNATIIMLATGTGIAPFRSFLWKMFFEKHDDYKFNGLAWLFLGVPTSSSLLYKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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