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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002218`

染色体: Chr08 坐标: 20176867-20181080 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002218`
名称	SmilChr08G002218
描述	GDP-L-galactose phosphorylase 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20176867 - 20181080 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001750`
GeneID	`131001750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001750`
原始查询	`SmilChr08G002218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDP-L-galactose phosphorylase 2-like
产物	GDP-L-galactose phosphorylase 2-like
Arabidopsis	`AT4G26850` (VTC2) GDP-L-galactose phosphorylase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828792] identity=63.5; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0190000` (OsGGP) - identity=65.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006006 (glucose metabolic process); GO:0080048 (GDP-D-glucose phosphorylase activity)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF26216 (GDPGP1_C); PF26217 (GDPGP1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784301.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057784301.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784301.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784301.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20177283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:20177402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:20179131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:20179716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:20179910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:20179917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B70,C53
`Chr8:20179969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:20180437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784301.1

445 aa

222

445

GDPGP1_N

GDPGP1_C

PF26217 GDPGP1_N 83-256 aa PF26216 GDPGP1_C 263-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784301.1`	Pfam	`PF26217`	GDPGP1_N	Domain	83	256	1.7e-76	256.4	GDPGP1-like, N-terminal domain
`XP_057784301.1`	Pfam	`PF26216`	GDPGP1_C	Domain	263	411	7.3e-66	221.2	GDPGP1-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928318.1
GATAAAAGAGGCCCAGCCTCCCAGTTTTGACCCACAATTGCATTTTGTAGATGCAGAGGCAGAGAGCCTTCAAATCTCAAAATCCAAACACGTCTCTCTCTCTCTATACATATCCAACCATCCGACCACATCCTCCGGCGAATTAGCGATTACCAACACCTCAACCTTTCTCTGCTCTACGCTACGCTCCATCTCTCTCACCCTCGAATTTGTGGTGGCGTCTTCTGTTTTTTTTGTTGATTCAAATTGCAAAAACAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001750
ATGGTGTCTGTATTAGAGACGAAATTGACGATAAAGAGGGTGGCGACGGTGGTTTCTAACTACCAAGAGAATGCTTCTGCTGAAGACCTCAAAACTATGGCGCAGGGCTGCGGCCGCAATTGCCTCGGAAGCTGCTGCTTGCCTGTTTCGAAGCTACCTCTCTATGCATTCAATACTGCTGAGGAAGAGCTAGGTCACAACGAGGTTGATGGATCTTGTGATGGGAAATGTCCCAAAACGTCCAATTTGAACAACTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784301.1
MVSVLETKLTIKRVATVVSNYQENASAEDLKTMAQGCGRNCLGSCCLPVSKLPLYAFNTAEEELGHNEVDGSCDGKCPKTSNLNNLLLGQWEDRMTQGLFRYDVTSCETKVIPGTYGFIAQLNEGRHLKKRPTEFRVDKVLQPFDKNKFNFTKVGQEEVLFRFEPSENGKARYFPSTPIDPEKGPPSVVAINVSPIEYGHVLLIPRVLDCLPQKIVHECLLLALHFAKEASNPFFRVGYNSLGAFATINHLHFQAYYLSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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