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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002235`

染色体: Chr08 坐标: 20465416-20471175 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002235`
名称	SmilChr08G002235
描述	probable cytosolic oligopeptidase A
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20465416 - 20471175 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001765`
GeneID	`131001765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001765`
原始查询	`SmilChr08G002235`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cytosolic oligopeptidase A
产物	probable cytosolic oligopeptidase A
Arabidopsis	`AT5G65620` (AT5G65620) Zincin-like metalloproteases family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836688] identity=79.4; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0830100` - identity=78.4; qcov=0.842; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0006518 (peptide metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01432 (Peptidase_M3); PF19310 (TOP_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784314.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057784314.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057784314.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784314.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20465561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:20465595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:20465858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:20465925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr8:20466203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B117,B12
`Chr8:20466222`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B23
`Chr8:20466222`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B23
`Chr8:20466225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:20467351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:20468858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr8:20468901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:20468980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784314.1

824 aa

412

824

TOP_N

Peptidase_M3

PF19310 TOP_N 157-279 aa PF01432 Peptidase_M3 359-819 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784314.1`	Pfam	`PF19310`	TOP_N	Domain	157	279	1.6e-54	183.7	Neurolysin/Thimet oligopeptidase, N-terminal domain
`XP_057784314.1`	Pfam	`PF01432`	Peptidase_M3	Family	359	819	9.6e-137	457.7	Peptidase family M3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928331.1
CTTCAAATTATTTTAGATTTAGCCCTTAATATATGGATTTAGTAAGGATTTTAGATTATTTTGTTGTGCTATAGGCTATAGCTATACATCGAATCGAAGAGGATTCTGGGGTTGATGAACAAGATGAGATCCGGATGGAGCCGCACCGTACCCGGCCCCGCCCCATTTCCCCACATCTCCTCTATCCATTTTCTTGTTTTAGGCTTCCTATTTCTTCTCATGGCGTCCTTGTTATCTCTCTCTCGGTCTATCCATTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001765
ATGAACAAGATGAGATCCGGATGGAGCCGCACCGTACCCGGCCCCGCCCCATTTCCCCACATCTCCTCTATCCATTTTCTTGTTTTAGGCTTCCTATTTCTTCTCATGGCGTCCTTGTTATCTCTCTCTCGGTCTATCCATTTCCAACCCGTCTGCCTCATTAAACCCTCTGCTCTCAAACCTCGTTTCCCGTTTTACCCCGCTTCCCCTCTCAAATCCCGTCCCTGTCCCCTCTGGTCTTCCTCCTTCTCCGTCTGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784314.1
MNKMRSGWSRTVPGPAPFPHISSIHFLVLGFLFLLMASLLSLSRSIHFQPVCLIKPSALKPRFPFYPASPLKSRPCPLWSSSFSVCLLRSRARSHHSSLRTPIRSEPLRSPPSLRSFCASAASDVVEMADTEANPLLKDFYFPPFDLIQAEHVRPGIRALLKKSESDLEELERTVEPTWPKLVEPLERIVDRMAVVWGAVSHLKAVKDNADLRSAIEEVQPEKVAFELKLGQSKPIYNAFKAIRESPDWEKLSDARKRIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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