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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002280`

染色体: Chr08 坐标: 21207645-21209397 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002280`
名称	SmilChr08G002280
描述	cysteine desulfurase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21207645 - 21209397 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001805`
GeneID	`131001805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001805`
原始查询	`SmilChr08G002280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine desulfurase, mitochondrial
产物	cysteine desulfurase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G65720` (NFS1) nitrogen fixation S (NIFS)-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836701] identity=76.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0338400` (OsISC1) - identity=78.7; qcov=0.901; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding); GO:0031071 (cysteine desulfurase activity); GO:0044571 ([2Fe-2S] cluster assembly)
KEGG	smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04122 (Sulfur relay system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00266 (Aminotran_5); PF01041 (DegT_DnrJ_EryC1); PF01212 (Beta_elim_lyase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784381.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057784381.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784381.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784381.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21207853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C14
`Chr8:21208128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C14
`Chr8:21208188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B139,B61,C25
`Chr8:21208516`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr8:21208516`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr8:21208518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:21208749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784381.1

454 aa

227

454

Aminotran_5

Beta_elim_lyase

DegT_DnrJ_EryC1

PF00266 Aminotran_5 57-418 aa PF01212 Beta_elim_lyase 100-231 aa PF01041 DegT_DnrJ_EryC1 118-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784381.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	57	418	3e-87	293.7	Aminotransferase class-V
`XP_057784381.1`	Pfam	`PF01212`	Beta_elim_lyase	Domain	100	231	2.4e-08	34.4	Beta-eliminating lyase
`XP_057784381.1`	Pfam	`PF01041`	DegT_DnrJ_EryC1	Domain	118	235	1.6e-06	28.4	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928398.1
GTCATCGTATTTATATAGGAGTAGTAAATAATTTCTCATTATTTTTATCGAATATATTTTCCTACAATCTGAGTGTTGAGGTTTAACCTCACAGCAGCAGCAGGTTTCCCCCAAATCGAACGGTATCCGATAAGCTAGGGCCACCTTGAAAATGTTCTCGAAGCTTCTCTCCACGGCCGTCCGCCGCAATCTGCTCCAGCCAACTGCCGTCCGACGCCTCCCCCAACCTTTCTCCACCGCCGCTGCCGCGGTGGAGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001805
ATGTTCTCGAAGCTTCTCTCCACGGCCGTCCGCCGCAATCTGCTCCAGCCAACTGCCGTCCGACGCCTCCCCCAACCTTTCTCCACCGCCGCTGCCGCGGTGGAGCCTCTGGAGGAGGATTCGAGCGGAGTAATGATGAAAGGAGTGAAGATCTCTGGCCGGCCCCTCTACCTCGATATGCAGGCGACTTCACCGGTCGACCCTAGGGTTCTCGATGCCATGCTCCCCTATTTGCTCTCCCGCTACGGAAACCCGCACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784381.1
MFSKLLSTAVRRNLLQPTAVRRLPQPFSTAAAAVEPLEEDSSGVMMKGVKISGRPLYLDMQATSPVDPRVLDAMLPYLLSRYGNPHSRTHLYGWESEKAVESARAQVAALINASPKEIIFTSGATESNNISVKGVMHFYKEKKRHVITTQTEHKCVLDSCRHLQQEGFDITYLPVKSDGLIDLEKLRAEIRPDTGLVSVMMVNNEIGVIQPMVEIGKICKEFNVPLHTDAAQALGKIPIDVDKMNISLMSLSGHKIYGPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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