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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002321`

染色体: Chr08 坐标: 21864566-21871082 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002321`
名称	SmilChr08G002321
描述	AP-4 complex subunit mu
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21864566 - 21871082 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001844`
GeneID	`131001844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001844`
原始查询	`SmilChr08G002321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-4 complex subunit mu
产物	AP-4 complex subunit mu
Arabidopsis	`AT4G24550` (AT4G24550) Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828557] identity=82.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0620300` (P0594D10.112) - identity=78.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0006605 (protein targeting); GO:0030131 (clathrin adaptor complex); GO:0031410 (cytoplasmic vesicle); GO:0090160 (Golgi to lysosome transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00928 (Adap_comp_sub); PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057784446.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057784446.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	1.00000	`XP_057784447.1`
4	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057784446.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.80000	`XP_057784447.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21865854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:21865955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:21866387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,D4
`Chr8:21866397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:21869789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784446.1

451 aa

226

451

Clat_adaptor_s

Adap_comp_sub

PF01217 Clat_adaptor_s 1-132 aa PF00928 Adap_comp_sub 182-451 aa

XP_057784447.1

348 aa

174

348

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 79-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784446.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	1	132	4.5e-05	24.1	Clathrin adaptor complex small chain
`XP_057784446.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	182	451	2.5e-78	263.7	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057784447.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	79	348	1.2e-78	264.8	Adaptor complexes medium subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928463.1
ATACTATCAATAAATCGACTCAATAGTTAACGAATAGAATTTTGAAGAAGCTATTCGATCTGAAATACGATCCCAACTGCGGGAGAGAATCGTAAAATTAGAATGCTGCGAGGGGTTAATAGCAATTTCCCCTTTTAAGAAAATAACACATGTTCTTCATACATTACTCGTTATGCTCGATTCAGAAAATCGATTTGAGCGAGCTGTGAGTTGTGGCGGTTAGCTGTTCATCGTGATGATCTCCCAGTTCTTCGTGCTTT...

XM_057928464.1
AGTTTCTTCTTTACGCTTCAGCTGTCCGATTATATAATTATTATTATTTTCATCTGGTAATTGCTTTGAACTTTTTGCCATACTTTAGATTCAGTTTACTGTAGGAAGGTGATGTTCGTTGGATGTTTGAATTCGATGTTTTCTAAAATTCTATGCAGATCTGTTACTTAGACAGGAATCAGAGTGGTGTCTTAGTTAATAGGTATAGGCGAGGGGGGGCTTTATATTTGCATGACGATAATTCTTTGGAGTTTCAAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001844
ATGATCTCCCAGTTCTTCGTGCTTTCGCAGAGAGGCGATAACATCGTCTTTCGAGACTACCGTCGTGACGTACAGAAAGGAAGTGCAGAGATATTCTTCCGCAAAGTAAAGTTCTGGAAAGAAGATGGCAAAGAGGAAGCACCACCTGTATTTAATCTGGATGGCGTAAACTATTTCCATGTGAAGGTTGTTGGCCTGCTCTTTGTTGCAACCACAAGAACCAACTTGTCCCCTTCCTTAGCTTTAGAGCTTCTGCAGAG...

LOC131001844
ATGCGAAAAAATTTTGTTCTTGTCTATGAGCTGCTTGATGAAGTGATAGATTTTGGGTATGTTCAAACAACATCTACTGAGGTATTGAAGTCTTATGTATTCAATGAACCAATTGTGGTTGATGCTGCACGCTTGCCGACTCTGGGCCCTGCAGCCTTATTTATGCAAGGAAACAAACGAATGCCTGGTACAGCTGTTACAAAATCAGTCGTGGCAAATGACCCCGGGGGTAGGAAAAGGGAGGAAATCTTTGTTGATAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784446.1
MISQFFVLSQRGDNIVFRDYRRDVQKGSAEIFFRKVKFWKEDGKEEAPPVFNLDGVNYFHVKVVGLLFVATTRTNLSPSLALELLQRIARAIKDYLGVLNEESMRKNFVLVYELLDEVIDFGYVQTTSTEVLKSYVFNEPIVVDAARLPTLGPAALFMQGNKRMPGTAVTKSVVANDPGGRKREEIFVDIIEKISVTFSSSGYVLTSEIDGTIQMKSYLTGNPEIRLALNDDLHIGRGSVPHFGYSGSSGSGAVILDDCN...

XP_057784447.1
MRKNFVLVYELLDEVIDFGYVQTTSTEVLKSYVFNEPIVVDAARLPTLGPAALFMQGNKRMPGTAVTKSVVANDPGGRKREEIFVDIIEKISVTFSSSGYVLTSEIDGTIQMKSYLTGNPEIRLALNDDLHIGRGSVPHFGYSGSSGSGAVILDDCNFHESVHMDSFDIDRTLSLVPPDGEFPVMNYRITQEFKPPFTINTLIEEAGSLKAEVILKIRAEFPSSITANTIFIEMPLPTYTTRVNFDLERGIVGQNADFKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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