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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002346`

染色体: Chr08 坐标: 22178249-22182138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002346`
名称	SmilChr08G002346
描述	phosphoglycolate phosphatase 1A, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22178249 - 22182138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001871`
GeneID	`131001871`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001871`
原始查询	`SmilChr08G002346`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglycolate phosphatase 1A, chloroplastic-like
产物	phosphoglycolate phosphatase 1A%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G36790` (AT5G36790) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833646] identity=74.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0490800` (Os4NPP1) - identity=88.5; qcov=0.791; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00702 (Hydrolase); PF09419 (PGP_phosphatase); PF13242 (Hydrolase_like); PF13344 (Hydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001871

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784485.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057784485.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784485.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784485.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22178410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C71
`Chr8:22178781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784485.1

373 aa

186

373

Hydrolase

Hydrolase_6

Hydrolase_like

PGP_phosphatase

PF00702 Hydrolase 91-330 aa PF13344 Hydrolase_6 93-195 aa PF13242 Hydrolase_like 290-364 aa PF09419 PGP_phosphatase 297-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784485.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	91	330	2.4e-16	61.4	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057784485.1`	Pfam	`PF13344`	Hydrolase_6	Domain	93	195	1.1e-35	122.4	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057784485.1`	Pfam	`PF13242`	Hydrolase_like	Domain	290	364	8.2e-21	74.4	HAD-hyrolase-like
`XP_057784485.1`	Pfam	`PF09419`	PGP_phosphatase	Family	297	340	2.5e-05	24.6	Mitochondrial PGP phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928502.1
TTTATTATAATTTTTTTTTAATGAAAAAGCAATATCCAACGGCACAAAAATTCCAGAATCACAAATTTGATGGACAAAATCATCCACTCATATTTTCCACCTCATCCAAATAACTAACCATAAACAGCCCAACGATCTCAAACTCAACTGAACTGCCTGCAACAAAAGAGGGGGGAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAGCAGCCACAGAAATGCTGACTACCAAACTGTCAGCAGCTGCAGTCTCTTCATCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001871
ATGCTGACTACCAAACTGTCAGCAGCTGCAGTCTCTTCATCTTCTTCCACTATCTTCCTGAATTCCCACAGCAGATTGAGATTCAGCAAGAGAATCCCTTTTCTCGCCAACCCGTCTCTCTTCAATCCTCTCAGACCCATTGTTGAATGTAGCTCTTCTGCTAAGAAGAACTCCTCAAGAAATATGGATTCTTCTGCTTCTTCGAGGATTGTGAGCCCGCGTGCCGCTGCCGAGCAGCTCAAAGACCCCGATCAGCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784485.1
MLTTKLSAAAVSSSSSTIFLNSHSRLRFSKRIPFLANPSLFNPLRPIVECSSSAKKNSSRNMDSSASSRIVSPRAAAEQLKDPDQLIDSVETFIFDCDGVIWKGDKLIDGVPETLDMLRSKGKRLVFVTNNSTKSRKQYGKKFETLGLNVTEEEIFASSFAAAAYLKSIDFPKDKKVYVVGEEGILKELDLAGFQYLGGPEDGDKKIELKPGFLMEHDESVGAVVVGFDRYFNYYKIQYATLCIRENPGCLFIATNRDAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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